معرفی شرکت ها

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

ویژگی	مقدار
سیستم عامل	-
نام فایل	campa-1.1.0
نام	campa
نسخه کتابخانه	1.1.0
نگهدارنده	['Hannah Spitzer, Scott Berry']
ایمیل نگهدارنده	['hannah.spitzer@helmholtz-muenchen.de, scott.berry@unsw.edu.au']
نویسنده	Hannah Spitzer, Scott Berry
ایمیل نویسنده	hannah.spitzer@helmholtz-muenchen.de, scott.berry@unsw.edu.au
آدرس صفحه اصلی	https://github.com/theislab/campa
آدرس اینترنتی	https://pypi.org/project/campa/
مجوز	BSD

CAMPA - Conditional Autoencoder for Multiplexed Pixel Analysis ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ CAMPA is a framework for quantiative analysis of subcellular multi-channel imaging data. It consists of a workflow that generates consistent subcellular landmarks (CSLs) using conditional Variational Autoencoders (cVAE). The output of the CAMPA workflow is an `anndata`_ object that contains interpretable per-cell features summarizing the molecular composition and spatial arrangement of CSLs inside each cell. .. image:: https://raw.githubusercontent.com/theislab/campa/main/docs/source/_static/img/Figure1ab.jpg :alt: CAMPA title figure :width: 600px :align: center :target: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.05.07.490900v1 Visit our `documentation`_ for installation and usage examples. Manuscript ---------- Please see our preprint *"Learning consistent subcellular landmarks to quantify changes in multiplexed protein maps"* (`Spitzer, Berry et al. (2022)`_) to learn more. Installation ------------ CAMPA was developed for Python 3.9 and can be installed by running:: pip install campa Contributing ------------ We are happy about any contributions! Before you start, check out our `contributing guide`_. .. _anndata: https://anndata.readthedocs.io/en/stable/ .. _documentation: https://campa.readthedocs.io/en/stable/ .. _`data and experiment paths`: https://campa.readthedocs.io/en/stable/overview.html#campa-config .. _`Spitzer, Berry et al. (2022)`: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.05.07.490900v1 .. _contributing guide: https://github.com/theislab/campa/blob/main/CONTRIBUTING.rst

نیازمندی

مقدار	نام
-	numba
>=1.2.0	pandas
>=1.8.0	scanpy[leiden]
-	scikit-learn
-	squidpy
<2.11,>=2.6	tensorflow
>=4.50.2	tqdm
>=2.9.0	pre-commit
-	ipykernel
==3.0.3	jinja2
>=0.8.1	nbsphinx
-	pypandoc
>=4	sphinx
-	sphinx-argparse
>=1.10.3	sphinx-autodoc-typehints
-	sphinx-rtd-theme
-	sphinxcontrib-spelling
>=3.20.1	tox
-	pytest
-	pytest-cov
-	pytest-dependency

نحوه نصب

نصب پکیج whl campa-1.1.0:

pip install campa-1.1.0.whl

نصب پکیج tar.gz campa-1.1.0:

pip install campa-1.1.0.tar.gz