معرفی شرکت ها
bucky-covid-1.0.0a0.post2
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشترتوضیحات
The Bucky model is a spatial SEIR model for simulating COVID-19 at the county level.
| ویژگی | مقدار |
|---|---|
| سیستم عامل | - |
| نام فایل | bucky-covid-1.0.0a0.post2 |
| نام | bucky-covid |
| نسخه کتابخانه | 1.0.0a0.post2 |
| نگهدارنده | [] |
| ایمیل نگهدارنده | [] |
| نویسنده | Matt Kinsey |
| ایمیل نویسنده | matt@mkinsey.com |
| آدرس صفحه اصلی | https://buckymodel.com |
| آدرس اینترنتی | https://pypi.org/project/bucky-covid/ |
| مجوز | - |
# Bucky Model
[](https://bucky.readthedocs.io/en/latest/)
[](https://www.codefactor.io/repository/github/mattkinsey/bucky/overview/master)
**[Documentation](https://bucky.readthedocs.io/en/latest/)**
**[Developer Guide](https://github.com/mattkinsey/bucky/blob/poetry/dev_readme.md)**
The Bucky model is a spatial SEIR model for simulating COVID-19 at the county level.
## Getting Started
### Requirements
The Bucky model currently supports Linux and OSX and includes GPU support for accelerated modeling and processing.
* ``git`` must be installed and in your PATH.
* GPU support requires a cupy-compatible CUDA installation. See the [CuPy docs](https://docs.cupy.dev/en/stable/install.html#requirements) for details.
### Installation
Standard installation:
```bash
pip install bucky-covid
```
### Choose a working directory
Bucky will produce multiple folders for historical data and outputs. It's recommended to put these in their own directory, for example ``~/bucky``
```bash
BUCKY_DIR=~/bucky
mkdir $BUCKY_DIR
cd $BUCKY_DIR
```
### Configuration
The default configuration for bucky is located [here](https://github.com/mattkinsey/bucky/tree/master/bucky/base_config). Currently, you can locally modify these options by creating a ``bucky.yml`` in ``BUCKY_DIR`` that will override any of the default options specified in it.
TODO this is WIP and does not work yet:
~~To use a customized configuration you first need to make a local copy of the bucky configuration. In your working directory:~~
```bash
bucky cfg install-local
```
### Download Input Data
To download the required input data to the ``data_dir`` specified in the configuration files (default is ```$(pwd)/data```:
```bash
bucky data sync
```
### Running the Model
To run the model with default settings and produce standard outputs.
```bash
bucky run
```
Equivalently, one can the following command (to provide cli configuration to each part of the process)
```bash
bucky run model
bucky run postprocess
bucky viz plot
```
### CLI options
Each ```bucky``` command has options that can be detailed with the ``--help`` flag. e.g.
$ bucky run model --help
Usage: bucky run model [OPTIONS]
`bucky run model`, run the model itself, dumping raw monte
carlo output to raw_output_dir.
Options:
-d INTEGER Number of days to project forward
[default: 30]
-s INTEGER Global PRNG seed [default: 42]
-n INTEGER Number of Monte Carlo iterations [default:
100]
--runid TEXT UUID name of current run [default:
2022-06-04__08_00_03]
--start-date TEXT Start date for the simulation. (YYYY-MM-DD)
--help Show this message and exit.
Further CLI documentation is available in the [documentation](https://docs.buckymodel.com/en/latest/cli.html).
نیازمندی
| مقدار | نام |
|---|---|
| >=0.10.2,<0.11.0 | geopandas |
| >=1.1.0,<2.0.0 | joblib |
| >=3.5.2,<4.0.0 | matplotlib |
| >=1.22.4,<2.0.0 | numpy |
| >=1.4.2,<2.0.0 | pandas |
| >=1.8.1,<2.0.0 | scipy |
| >=4.64.0,<5.0.0 | tqdm |
| >=0.4.1,<0.5.0 | typer |
| >=2.0.2,<3.0.0 | us |
| >=10.5.0,<11.0.0 | cupy |
| >=2.10.0,<3.0.0 | optuna |
| >=0.9.0,<0.10.0 | scikit-optimize |
| >=0.6.0,<0.7.0 | loguru |
| >=0.3.3,<0.4.0 | better-exceptions |
| >=0.17.21,<0.18.0 | ruamel.yaml |
| >=0.8.1,<0.9.0 | fastparquet |
| >=5.15.6,<6.0.0 | PyQt5 |
زبان مورد نیاز
| مقدار | نام |
|---|---|
| >=3.8,<3.11 | Python |
نحوه نصب
نصب پکیج whl bucky-covid-1.0.0a0.post2:
pip install bucky-covid-1.0.0a0.post2.whl
نصب پکیج tar.gz bucky-covid-1.0.0a0.post2:
pip install bucky-covid-1.0.0a0.post2.tar.gz