معرفی شرکت ها

brighteyes-ism-1.1.0

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
1.1.0
1.0.2
1.0.1
1.0.0
0.1.1
0.1.0
1.1.0
1.0.2
1.0.1
1.0.0
0.1.1
0.1.0

توضیحات

A toolbox for analysing and simulating ISM images
ویژگی مقدار
سیستم عامل -
نام فایل brighteyes-ism-1.1.0
نام brighteyes-ism
نسخه کتابخانه 1.1.0
نگهدارنده []
ایمیل نگهدارنده []
نویسنده Alessandro Zunino
ایمیل نویسنده Alessandro Zunino <alessandro.zunino@iit.it>
آدرس صفحه اصلی https://github.com/VicidominiLab/brighteyes-ism
آدرس اینترنتی https://pypi.org/project/brighteyes-ism/
مجوز -
# BrightEyes-ISM [![License](https://img.shields.io/pypi/l/brighteyes-ism.svg?color=green)](https://github.com/VicidominiLab/BrightEyes-ISM/blob/main/LICENSE) [![PyPI](https://img.shields.io/pypi/v/brighteyes-ism.svg?color=green)](https://pypi.org/project/brighteyes-ism/) [![Python Version](https://img.shields.io/pypi/pyversions/brighteyes-ism.svg?color=green)](https://python.org) <!-- [![tests](https://github.com/VicidominiLab/napari-ISM/workflows/tests/badge.svg)](https://github.com/VicidominiLab/napari-ISM/actions) [![codecov](https://codecov.io/gh/VicidominiLab/napari-ISM/branch/main/graph/badge.svg)](https://codecov.io/gh/VicidominiLab/napari-ISM) --> A toolbox for analysing and simulating Image Scanning Microscopy (ISM) datasets. The analysis module contains libraries for: * Adaptive Pixel Reassignment (https://doi.org/10.1038/s41592-018-0291-9) * Focus-ISM (https://doi.org/10.1038/s41467-022-35333-y) * Image Deconvolution (https://doi.org/10.48550/arXiv.2211.12510) * Fourier Ring Correlation (https://doi.org/10.1038/s41467-019-11024-z) The simulation module contains libraries for: * Generation of ISM point spread functions (https://doi.org/10.1016/j.cpc.2022.108315) * Generation of tubulin phantom samples The dataio module contains libraries for * Reading the data and metadata from the MCS software (https://github.com/VicidominiLab/BrightEyes-MCS) ---------------------------------- ## Installation You can install `brighteyes-ism` via [pip] directly from GitHub: pip install git+https://github.com/VicidominiLab/BrightEyes-ISM or using the version on [PyPI]: pip install brighteyes-ism It requires the following Python packages numpy scipy matplotlib scikit-image scikit-learn poppy PyCustomFocus h5py tqdm statsmodels ## Documentation You can find an example of usage here: https://github.com/VicidominiLab/BrightEyes-ISM/tree/main/examples You can read the manual of this package on Read the Docs: https://brighteyes-ism.readthedocs.io ## Contributing Contributions are very welcome. Tests can be run with [tox], please ensure the coverage at least stays the same before you submit a pull request. ## License Distributed under the terms of the [GNU GPL v3.0] license, "BrightEyes-ISM" is free and open source software ## Issues If you encounter any problems, please [file an issue] along with a detailed description. [MIT]: http://opensource.org/licenses/MIT [BSD-3]: http://opensource.org/licenses/BSD-3-Clause [GNU GPL v3.0]: http://www.gnu.org/licenses/gpl-3.0.txt [GNU LGPL v3.0]: http://www.gnu.org/licenses/lgpl-3.0.txt [Apache Software License 2.0]: http://www.apache.org/licenses/LICENSE-2.0 [Mozilla Public License 2.0]: https://www.mozilla.org/media/MPL/2.0/index.txt [file an issue]: https://github.com/VicidominiLab/brighteyes-ism/issues [tox]: https://tox.readthedocs.io/en/latest/ [pip]: https://pypi.org/project/pip/ [PyPI]: https://pypi.org/project/brighteyes-ism/


نیازمندی

مقدار نام
- numpy
- scipy
- scikit-image
- scikit-learn
- matplotlib
- joblib
- poppy
- PyCustomFocus
- tqdm
- h5py
- statsmodels
- tox
- pytest
- pytest-cov
- pytest-qt
- napari
- pyqt5


زبان مورد نیاز

مقدار نام
>=3.7 Python


نحوه نصب


نصب پکیج whl brighteyes-ism-1.1.0:

    pip install brighteyes-ism-1.1.0.whl


نصب پکیج tar.gz brighteyes-ism-1.1.0:

    pip install brighteyes-ism-1.1.0.tar.gz