معرفی شرکت ها

breathXplorer-0.1.5

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
0.1.5
0.1.4
0.1.5
0.1.4

توضیحات

A toolkit for breath metabolomics analysis
ویژگی مقدار
سیستم عامل -
نام فایل breathXplorer-0.1.5
نام breathXplorer
نسخه کتابخانه 0.1.5
نگهدارنده []
ایمیل نگهدارنده []
نویسنده wykswr
ایمیل نویسنده bifocal.above.0y@icloud.com
آدرس صفحه اصلی https://github.com/wykswr/breathXplorer
آدرس اینترنتی https://pypi.org/project/breathXplorer/
مجوز MIT
# breathXplorer BreathXplorer is a toolkit for the analysis of breath metabolomics data. ## Installation `pip install breathXplorer` ## Usage ### File format The input file should be mzML format. ### Feature extraction The feature extraction is performed using the `find_feature` function. The function takes as input the path to the mzMl file, and returns a pandas dataframe with the extracted features. ```python from breathXplorer import find_feature tb = find_feature("sample.mzML", False, .2, "Topological", 6) ``` The extracted feature table has the m/z values as index, and the total intensity over time as the first column, the rest of the columns are times. ### Merge feature tables The `merge_feature` function takes as input a list of extracted feature table, and returns a merged feature table. ```python from breathXplorer import merge_result, find_feature tbs = [find_feature(f, False, .2, "Topological", 6) for f in ["sample1.mzML", "sample2.mzML", "sample3.mzML"]] tb = merge_result(tbs, ["sample1", "sample2", "sample3"]) ``` The merged feature table has the m/z values as index, and sample names as columns. The values are the total intensity over time.


نیازمندی

مقدار نام
- lxml
- numba
- numpy
- pandas
- pyteomics
- scikit-learn
- scipy


نحوه نصب


نصب پکیج whl breathXplorer-0.1.5:

    pip install breathXplorer-0.1.5.whl


نصب پکیج tar.gz breathXplorer-0.1.5:

    pip install breathXplorer-0.1.5.tar.gz