معرفی شرکت ها

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

End-guided transcript assembler for short and long RNA-seq reads.

ویژگی	مقدار
سیستم عامل	-
نام فایل	bookend-rna-1.1.0
نام	bookend-rna
نسخه کتابخانه	1.1.0
نگهدارنده	[]
ایمیل نگهدارنده	[]
نویسنده	Michael A. Schon
ایمیل نویسنده	michael.schon@wur.nl
آدرس صفحه اصلی	https://github.com/Gregor-Mendel-Institute/bookend
آدرس اینترنتی	https://pypi.org/project/bookend-rna/
مجوز	-

# /| bookend |\\ ### End-guided transcriptome assembly. Bookend is a comprehensive framework for end-guided assembly of short-read, long-read, and end-capture RNA-seq data. Please see the [User Guide](Bookend_User_Guide.pdf) for a full description of the subcommands and arguments. ## Installation Bookend can be installed through the Python Package Index (PyPI) on UNIX systems with Python 3.6+ using the command pip install bookend-rna Once installed, all utilities can be accessed on the command as bookend subcommands: usage: bookend [subcommand] [options] [input file(s)] Subcommands (use -h/--help for more info): label (Label 5' and 3' ends in a FASTQ file) assemble (Assemble transcripts from aligned end-labeled reads) merge (Merge assembled GTFs with a reference annotation) --end-labeled read (ELR) operations-- make-elr sort-elr combine-elr --file conversion-- bed-to-elr elr-to-bed gtf-to-bed sam-to-sj sj-to-bed sj-merge --setup/indexing-- index-fasta softbridge-fasta

زبان مورد نیاز

مقدار	نام
>=3.6	Python

نحوه نصب

نصب پکیج whl bookend-rna-1.1.0:

pip install bookend-rna-1.1.0.whl

نصب پکیج tar.gz bookend-rna-1.1.0:

pip install bookend-rna-1.1.0.tar.gz