معرفی شرکت ها

blik-0.3.4

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

Python tool for visualising and interacting with cryo-ET and subtomogram averaging data.
ویژگی مقدار
سیستم عامل -
نام فایل blik-0.3.4
نام blik
نسخه کتابخانه 0.3.4
نگهدارنده []
ایمیل نگهدارنده []
نویسنده Blik Team
ایمیل نویسنده blik-team@googlegroups.com
آدرس صفحه اصلی https://github.com/gutsche-lab/blik
آدرس اینترنتی https://pypi.org/project/blik/
مجوز GNU General Public License v3 (GPLv3)
![logo](https://github.com/gutsche-lab/blik/raw/main/docs/images/logo.png) # `blik` ![Codecov branch](https://img.shields.io/codecov/c/github/gutsche-lab/blik/main?label=codecov) ![PyPI](https://img.shields.io/pypi/v/blik) ![PyPI - Python Version](https://img.shields.io/pypi/pyversions/blik) *it means glance in Dutch* ![blik showcase](https://user-images.githubusercontent.com/23482191/161224963-ad746a06-c2e5-46fe-a13b-f356bc4ad72b.png) **`blik`** is a tool for visualising and interacting with cryo-ET and subtomogram averaging data. It leverages the fast, multi-dimensional [napari viewer](https://napari.org) and the scientific python stack. **DISCLAIMER**: this package is in development phase. Expect frequent bugs and crashes. Please, report them on the issue tracker and ask if anything is unclear! ## Installation You can either install `blik` through the [napari plugin system](https://napari.org/plugins/index.html), through pip, or get both napari and blik directly with: ```bash pip install "blik[all]" ``` The `[all]` qualifier also installs `pyqt5` as the napari GUI backend, and a few additional napari plugins that you might find useful in your workflow: - [napari-properties-plotter](https://github.com/brisvag/napari-properties-plotter) - [napari-properties-viewer](https://github.com/kevinyamauchi/napari-properties-viewer) - [napari-label-interpolator](https://github.com/kevinyamauchi/napari-label-interpolator) ## Basic Usage From the command line: ```bash napari -w blik -- /path/to.star /path/to/mrc/files/* ``` The `-w blik` is important for proper initialization of all the layers. Keep the main widget open to ensure nothing goes wrong! *`blik` is just `napari`*. Particles and images are exposed as simple napari layers, which can be analysed and manipulated with simple python, and most importantly other [napari plugins](https://napari-hub.org/). ## Widget The main widget has a few functions:


نیازمندی

مقدار نام
- numpy
- dask
- pandas
- scipy
>=0.4.0 magicgui
>=0.3.2 cryohub
- cryotypes
>=0.4.17 napari[all]
- napari-properties-plotter
- napari-properties-viewer
- napari-label-interpolator
- black
- flake8
- isort
- pre-commit
>=0.4.17 napari[all]
- tox
- pytest
- pytest-qt
- pyqt5
>=0.4.17 napari[all]
- tox
- pytest
- pytest-qt
- pyqt5


زبان مورد نیاز

مقدار نام
>=3.8 Python


نحوه نصب


نصب پکیج whl blik-0.3.4:

    pip install blik-0.3.4.whl


نصب پکیج tar.gz blik-0.3.4:

    pip install blik-0.3.4.tar.gz