معرفی شرکت ها


bitia-0.2.3.dev1678436579


Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

BioInformatics Tool for Infrastructure Automation (BiTIA) CLI utility.
ویژگی مقدار
سیستم عامل -
نام فایل bitia-0.2.3.dev1678436579
نام bitia
نسخه کتابخانه 0.2.3.dev1678436579
نگهدارنده []
ایمیل نگهدارنده []
نویسنده Dilawar Singh
ایمیل نویسنده dilawar@subcom.tech
آدرس صفحه اصلی -
آدرس اینترنتی https://pypi.org/project/bitia/
مجوز -
<link rel="stylesheet" type="text/css" href="https://raw.githack.com/Ganz1285/termynal/master/termynal.css" /> # BioInformatics Tool for Infrastructure Automation (BiTIA) CLI utility This is the cli utility of the BiTIA project. The other component is `bitia-runner`. Most users only need the cli client `bitia` to submit jobs. Install it using `pip`. ``` python -m pip install bitia --user python -m bitia --help ``` ## Configuration TODO: Order of searching configuration file. ### Unix like systems 1. `./bitia.toml` 2. `~/.bitia.toml` 3. `$HOME/.config/bitia.toml` 3. `/etc/bitia.toml` ### Windows 1. `bitia.toml` 2. `%APPDATA%\bitia.toml` 3. `%PROGRAMDATA%\bitia.toml` ## BiTIA runner If you are self-hosting the BiTIA server, you need `bitia-runner` as well. See the documents of `bitia-runner` for more details. TODO. ## EXAMPLES 1. Using samtools to view a fastq file with same name as provided in url NORMAL PIPELINE EXECUTION CODE | BITIA EXECUTION CODE :-------------------------:|:-------------------------: ![](./docs/source/img/readme_example_1.gif) |![](./docs/source/img/readme_example_1_bitia.gif) 2. Using samtools to view a fastq file with different file name as provided in url NORMAL PIPELINE EXECUTION CODE | BITIA EXECUTION CODE :-------------------------:|:-------------------------: ![](./docs/source/img/readme_example_2.gif) |![](./docs/source/img/readme_example_2_bitia.gif) 3. Using Fastqc to do Quality check on a fastq file with same file name as provided NORMAL PIPELINE EXECUTION CODE | BITIA EXECUTION CODE :-------------------------:|:-------------------------: ![](./docs/source/img/readme_example_3.gif) |![](./docs/source/img/readme_example_3_bitia.gif)


نیازمندی

مقدار نام
>=3.0.9,<4.0.0 pyparsing
>=2.28.1,<3.0.0 requests
>=12.5.1,<13.0.0 rich
>=0.6.1,<0.7.0 typer
>=0.20.0,<0.21.0 validators


زبان مورد نیاز

مقدار نام
>=3.8,<4.0 Python


نحوه نصب


نصب پکیج whl bitia-0.2.3.dev1678436579:

    pip install bitia-0.2.3.dev1678436579.whl


نصب پکیج tar.gz bitia-0.2.3.dev1678436579:

    pip install bitia-0.2.3.dev1678436579.tar.gz