معرفی شرکت ها
bioversions-0.5.99
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
0.5.99
0.5.98
0.5.97
0.5.96
0.5.95
0.5.94
0.5.93
0.5.92
0.5.91
0.5.90
0.5.9
0.5.89
0.5.88
0.5.87
0.5.86
0.5.85
0.5.84
0.5.83
0.5.82
0.5.81
0.5.80
0.5.8
0.5.79
0.5.78
0.5.77
0.5.76
0.5.75
0.5.74
0.5.73
0.5.72
0.5.71
0.5.70
0.5.7
0.5.69
0.5.68
0.5.67
0.5.66
0.5.65
0.5.64
0.5.63
0.5.62
0.5.61
0.5.60
0.5.6
0.5.59
0.5.58
0.5.57
0.5.56
0.5.55
0.5.54
0.5.53
0.5.52
0.5.51
0.5.50
0.5.5
0.5.49
0.5.48
0.5.47
0.5.46
0.5.45
0.5.44
0.5.43
0.5.42
0.5.41
0.5.40
0.5.4
0.5.39
0.5.38
0.5.37
0.5.36
0.5.35
0.5.34
0.5.33
0.5.32
0.5.31
0.5.30
0.5.3
0.5.29
0.5.28
0.5.27
0.5.26
0.5.25
0.5.24
0.5.23
0.5.22
0.5.21
0.5.20
0.5.2
0.5.19
0.5.18
0.5.17
0.5.16
0.5.15
0.5.14
0.5.13
0.5.124
0.5.123
0.5.122
0.5.121
0.5.120
0.5.12
0.5.119
0.5.118
0.5.117
0.5.116
0.5.115
0.5.114
0.5.113
0.5.112
0.5.111
0.5.110
0.5.11
0.5.109
0.5.108
0.5.107
0.5.106
0.5.105
0.5.104
0.5.103
0.5.102
0.5.101
0.5.100
0.5.10
0.5.1
0.5.0
0.4.9
0.4.8
0.4.77
0.4.76
0.4.75
0.4.74
0.4.73
0.4.72
0.4.71
0.4.70
0.4.7
0.4.69
0.4.68
0.4.67
0.4.66
0.4.65
0.4.64
0.4.63
0.4.62
0.4.61
0.4.60
0.4.6
0.4.59
0.4.58
0.4.57
0.4.56
0.4.55
0.4.54
0.4.53
0.4.52
0.4.51
0.4.50
0.4.5
0.4.49
0.4.48
0.4.47
0.4.46
0.4.45
0.4.44
0.4.43
0.4.42
0.4.41
0.4.40
0.4.4
0.4.39
0.4.38
0.4.37
0.4.36
0.4.35
0.4.34
0.4.33
0.4.32
0.4.31
0.4.30
0.4.3
0.4.29
0.4.28
0.4.27
0.4.26
0.4.25
0.4.24
0.4.23
0.4.22
0.4.21
0.4.20
0.4.2
0.4.19
0.4.18
0.4.17
0.4.16
0.4.15
0.4.14
0.4.13
0.4.12
0.4.11
0.4.10
0.4.1
0.4.0
0.3.6
0.3.5
0.3.4
0.3.3
0.3.2
0.3.1
0.3.0
0.2.0
0.1.3
0.1.2
0.1.1
0.1.0
0.0.9
0.0.8
0.0.7
0.0.6
0.0.5
0.0.4
0.0.3
0.0.2
0.0.11
0.0.10
0.0.1
0.5.99
0.5.98
0.5.97
0.5.96
0.5.95
0.5.94
0.5.93
0.5.92
0.5.91
0.5.90
0.5.9
0.5.89
0.5.88
0.5.87
0.5.86
0.5.85
0.5.84
0.5.83
0.5.82
0.5.81
0.5.80
0.5.8
0.5.79
0.5.78
0.5.77
0.5.76
0.5.75
0.5.74
0.5.73
0.5.72
0.5.71
0.5.70
0.5.7
0.5.69
0.5.68
0.5.67
0.5.66
0.5.65
0.5.64
0.5.63
0.5.62
0.5.61
0.5.60
0.5.6
0.5.59
0.5.58
0.5.57
0.5.56
0.5.55
0.5.54
0.5.53
0.5.52
0.5.51
0.5.50
0.5.5
0.5.49
0.5.48
0.5.47
0.5.46
0.5.45
0.5.44
0.5.43
0.5.42
0.5.41
0.5.40
0.5.4
0.5.39
0.5.38
0.5.37
0.5.36
0.5.35
0.5.34
0.5.33
0.5.32
0.5.31
0.5.30
0.5.3
0.5.29
0.5.28
0.5.27
0.5.26
0.5.25
0.5.24
0.5.23
0.5.22
0.5.21
0.5.20
0.5.2
0.5.19
0.5.18
0.5.17
0.5.16
0.5.15
0.5.14
0.5.13
0.5.124
0.5.123
0.5.122
0.5.121
0.5.120
0.5.12
0.5.119
0.5.118
0.5.117
0.5.116
0.5.115
0.5.114
0.5.113
0.5.112
0.5.111
0.5.110
0.5.11
0.5.109
0.5.108
0.5.107
0.5.106
0.5.105
0.5.104
0.5.103
0.5.102
0.5.101
0.5.100
0.5.10
0.5.1
0.5.0
0.4.9
0.4.8
0.4.77
0.4.76
0.4.75
0.4.74
0.4.73
0.4.72
0.4.71
0.4.70
0.4.7
0.4.69
0.4.68
0.4.67
0.4.66
0.4.65
0.4.64
0.4.63
0.4.62
0.4.61
0.4.60
0.4.6
0.4.59
0.4.58
0.4.57
0.4.56
0.4.55
0.4.54
0.4.53
0.4.52
0.4.51
0.4.50
0.4.5
0.4.49
0.4.48
0.4.47
0.4.46
0.4.45
0.4.44
0.4.43
0.4.42
0.4.41
0.4.40
0.4.4
0.4.39
0.4.38
0.4.37
0.4.36
0.4.35
0.4.34
0.4.33
0.4.32
0.4.31
0.4.30
0.4.3
0.4.29
0.4.28
0.4.27
0.4.26
0.4.25
0.4.24
0.4.23
0.4.22
0.4.21
0.4.20
0.4.2
0.4.19
0.4.18
0.4.17
0.4.16
0.4.15
0.4.14
0.4.13
0.4.12
0.4.11
0.4.10
0.4.1
0.4.0
0.3.6
0.3.5
0.3.4
0.3.3
0.3.2
0.3.1
0.3.0
0.2.0
0.1.3
0.1.2
0.1.1
0.1.0
0.0.9
0.0.8
0.0.7
0.0.6
0.0.5
0.0.4
0.0.3
0.0.2
0.0.11
0.0.10
0.0.1
توضیحات
What's the current version for each biological database?
| ویژگی | مقدار |
|---|---|
| سیستم عامل | - |
| نام فایل | bioversions-0.5.99 |
| نام | bioversions |
| نسخه کتابخانه | 0.5.99 |
| نگهدارنده | ['Charles Tapley Hoyt'] |
| ایمیل نگهدارنده | ['cthoyt@gmail.com'] |
| نویسنده | Charles Tapley Hoyt |
| ایمیل نویسنده | cthoyt@gmail.com |
| آدرس صفحه اصلی | https://github.com/biopragmatics/bioversions |
| آدرس اینترنتی | https://pypi.org/project/bioversions/ |
| مجوز | MIT |
<p align="center">
<img src="https://github.com/biopragmatics/bioversions/raw/main/docs/source/logo.png" height="150">
</p>
<h1 align="center">
Bioversions
</h1>
<p align="center">
<a href="https://pypi.org/project/bioversions">
<img alt="PyPI" src="https://img.shields.io/pypi/v/bioversions" />
</a>
<a href="https://pypi.org/project/bioversions">
<img alt="PyPI - Python Version" src="https://img.shields.io/pypi/pyversions/bioversions" />
</a>
<a href="https://github.com/biopragmatics/bioversions/blob/main/LICENSE">
<img alt="PyPI - License" src="https://img.shields.io/pypi/l/bioversions" />
</a>
<a href="https://zenodo.org/badge/latestdoi/318852276">
<img src="https://zenodo.org/badge/318852276.svg" alt="DOI" />
</a>
<a href="https://github.com/psf/black">
<img src="https://img.shields.io/badge/code%20style-black-000000.svg" alt="Code style: black">
</a>
<a href="https://github.com/biopragmatics/bioregistry"$>
<img alt="Powered by the Bioregistry" src="https://img.shields.io/static/v1?label=Powered%20by&message=Bioregistry&color=BA274A&style=flat&logo=image/png;base64,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" />
</a>
</p>
What's the current version for each biological database?
A daily updated static listing of all current versions (that are incorporated) can be found at
https://biopragmatics.github.io/bioversions.
## 🚀 Installation
```bash
$ pip install bioversions
```
## 💪 Usage
```python
import bioversions
assert bioversions.get_version('biogrid') == '4.2.192', 'This was true on Dec 5th, 2020!'
# If you want more information, use the resolve() function
bioversion = bioversions.resolve('biogrid')
assert bioversion.version == '4.2.192'
```
By default, the results are cached and only refreshed once per day with the help
of [`cachier`](https://github.com/shaypal5/cachier). The cache is stored in `~/.data/bioversions`. The cache location
can be overridden by setting the
`BIOVERSIONS_HOME` environment variable via [`pystow`](https://github.com/cthoyt/pystow).
## 🌐 Web Application
While https://biopragmatics.github.io/bioversions provides a daily updated static listing of the database, you can run a
dynamic version with an API from your shell with:
```bash
$ bioversions web
```
Options can be listed with `bioversions web --help`.
You can navigate to http://localhost:5000 to see all versions as HTML or programmatically resolve given databases with
the
`http://localhost:5000/database/<name>` endpoint like in the following:
```python
import requests
res = requests.get('http://localhost:5000/database/biogrid').json()
assert res['success']
assert res['result']['name'] == 'BioGRID'
assert res['result']['version'] == '4.2.192', 'This was true on Dec 5th, 2020!'
```
## CLI Usage
You can use `bioversions get` to incorporate the latest versions in your shell scripts or REPL usage like in:
```bash
$ wget "https://downloads.thebiogrid.org/Download/BioGRID/Release-Archive/BIOGRID-$(bioversions get biogrid)/BIOGRID-ALL-$(bioversions get biogrid).mitab.zip"
```
## 🙏 Contributing
To add more databases to the list, you can create a new submodule of
`bioversions.sources` and extend the `bioversions.utils.Getter` class to identify the most recent version for your
target database. See
`bioversions.sources.biogrid` as an example.
## 👋 Attribution
### ⚖️ License
Code is licensed under the MIT License.
### 🎁 Support
The Bioversions service was developed by the [INDRA Lab](https://indralab.github.io), a part of the
[Laboratory of Systems Pharmacology](https://hits.harvard.edu/the-program/laboratory-of-systems-pharmacology/about/)
and the [Harvard Program in Therapeutic Science (HiTS)](https://hits.harvard.edu)
at [Harvard Medical School](https://hms.harvard.edu/).
### 💰 Funding
The development of the Bioregistry is funded by the DARPA Young Faculty Award W911NF2010255 (PI:
Benjamin M. Gyori).
نیازمندی
| مقدار | نام |
|---|---|
| - | requests |
| - | requests-ftp |
| - | beautifulsoup4 |
| - | cachier |
| >=0.1.0 | pystow |
| - | click |
| - | click-default-group |
| - | dataclasses-json |
| - | tabulate |
| - | more-click |
| - | pyyaml |
| - | tqdm |
| >=0.5 | bioregistry[align] |
| - | lxml |
| - | psycopg2-binary |
| - | matplotlib |
| - | seaborn |
| - | slack-sdk |
| - | tweepy |
| - | flask |
| - | bootstrap-flask |
زبان مورد نیاز
| مقدار | نام |
|---|---|
| >=3.7 | Python |
نحوه نصب
نصب پکیج whl bioversions-0.5.99:
pip install bioversions-0.5.99.whl
نصب پکیج tar.gz bioversions-0.5.99:
pip install bioversions-0.5.99.tar.gz