معرفی شرکت ها


biotranslator-0.1.1


Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

BioTranslator: Cross-modal Translation for Zero-shot Biomedical Classification
ویژگی مقدار
سیستم عامل POSIX :: Linux
نام فایل biotranslator-0.1.1
نام biotranslator
نسخه کتابخانه 0.1.1
نگهدارنده []
ایمیل نگهدارنده ['Hanwen Xu <xuhw@cs.washington.edu>, Yunwei Zhao <yzhao4@cs.washington.edu>']
نویسنده Hanwen Xu, Yunwei Zhao, Addie Woicik, Hoifung Poon, Russ B.Altman, Sheng Wang
ایمیل نویسنده swang91@uw.edu
آدرس صفحه اصلی https://github.com/ywzhao2002/biotranslator
آدرس اینترنتی https://pypi.org/project/biotranslator/
مجوز MIT Licence
[![Stars](https://img.shields.io/github/stars/scverse/scanpy?logo=GitHub&color=yellow)](https://github.com/HanwenXuTHU/BioTranslatorProject) [![PyPI](https://img.shields.io/pypi/v/scanpy?logo=PyPI)](https://pypi.org/project/biotranslator/) [![PyPIDownload](https://static.pepy.tech/badge/biotranslator)](https://pepy.tech/project/biotranslator) [![Doc](https://readthedocs.org/projects/biotranslator/badge/?version=latest)](https://biotranslator.readthedocs.io/en/latest/?badge=latest) # BioTranslator API BioTranslator is a cross-modal translator which can annotate biology instances only using user-written texts. The codes here can reproduce the main results in BioTranslator paper, including zero-shot protein function prediction, zero-shot cell type prediction, and predict the nodes and edges of a gene pathway. BioTranslator takes a user-written textual description of the new discovery and then translates this description to a non-text biological data instance. Our tool frees scientists from limiting their analysis within predefined controlled vocabularies, thus accelerating new biomedical discoveries. [documentation]: https://biotranslator.readthedocs.io For more information, please visit the project's main repository [here](https://github.com/HanwenXuTHU/BioTranslatorProject).


نیازمندی

مقدار نام
- sentence-transformers
>=0.6.4 anndata
>=1.0 fbpca
>=0.3.10 umap-learn
>=2.0.2 matplotlib
>=1.16.4 numpy
>=1.3.1 scipy
>=0.21.3 scikit-learn
>=1.7.1 scanorama
==1.7.1 torch
- pandas
- tqdm
- networkx
- gensim
- nltk
==0.8.2 torchvision
- myst-parser


نحوه نصب


نصب پکیج whl biotranslator-0.1.1:

    pip install biotranslator-0.1.1.whl


نصب پکیج tar.gz biotranslator-0.1.1:

    pip install biotranslator-0.1.1.tar.gz