معرفی شرکت ها

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

biotoolkit contains GCfromDNA: Analyze GC-content of DNA sequences from fasta files

ویژگی	مقدار
سیستم عامل	-
نام فایل	biotoolkit-0.1.1
نام	biotoolkit
نسخه کتابخانه	0.1.1
نگهدارنده	[]
ایمیل نگهدارنده	[]
نویسنده	meh
ایمیل نویسنده	UNKNOWN
آدرس صفحه اصلی	UNKNOWN
آدرس اینترنتی	https://pypi.org/project/biotoolkit/
مجوز	UNKNOWN

biotoolkit contains: GCfromDNA.py GCfromDNA is a python module/command line utility for determining the GC content of DNA sequences, as read from standard fasta (.fa) files. This module formats each sequence name (replacing spaces with underscores), calculates the percentage GC-content for each sequence, and saves this data as a csv file with a modified version of the original filename (e.g., fasta_file_1.fa --> fasta_file_1_GC.csv). GCfromDNA utilizes parts of the biopython package for analysis. The package can be installed with the following command: $ pip install biopython To install biotoolkit: $ pip install biotoolkit Upon successful installation, the module can be imported into new python scripts with: from biotoolkit import GCfromDNA For instance, the following is a complete python script that will invoke the module's functionality: #!/usr/bin/env python from biotoolkit import GCfromDNA GCfromDNA.compute() It is possible to pass fasta filenames as parameters directly to the compute function. Filenames must be passed to the compute function as a list: GCfromDNA.compute( [file1,file2,file3] ) #if file1 == 'file1.fa', for instance GCfromDNA can be utilized interactively. From the command line, enter: $ python >>> from biotoolkit import GCfromDNA >>> GCfromDNA.compute() The script can be invoked directly from the directory where it resides. Optional filename arguments must be separated by spaces: $ python GCfromDNA.py file1.fa file2.fa file3.fa or alternatively: $ python GCfromDNA.py *.fa If no filename is provided, the program prompts the user to select from fasta files (located in the current directory) for processing.

نحوه نصب

نصب پکیج whl biotoolkit-0.1.1:

pip install biotoolkit-0.1.1.whl

نصب پکیج tar.gz biotoolkit-0.1.1:

pip install biotoolkit-0.1.1.tar.gz