معرفی شرکت ها

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

BioMAJ process service

ویژگی	مقدار
سیستم عامل	-
نام فایل	biomaj-process-3.0.9
نام	biomaj-process
نسخه کتابخانه	3.0.9
نگهدارنده	[]
ایمیل نگهدارنده	[]
نویسنده	Olivier Sallou
ایمیل نویسنده	olivier.sallou@irisa.fr
آدرس صفحه اصلی	http://biomaj.genouest.org
آدرس اینترنتی	https://pypi.org/project/biomaj-process/
مجوز	-

# About [![PyPI version](https://badge.fury.io/py/biomaj-process.svg)](https://badge.fury.io/py/biomaj-process) Microservice to manage the process execution of biomaj. A protobuf interface is available in biomaj_process/message/message_pb2.py to exchange messages between BioMAJ and the download service. Messages go through RabbitMQ (to be installed). # Protobuf To compile protobuf, in biomaj_process/message: protoc --python_out=. message.proto # Development flake8 biomaj_process CONFIG=tests/config.yml python -m pytest -v tests/biomaj_tests.py # Run ## Message consumer: export BIOMAJ_CONFIG=path_to_config.yml python bin/biomaj_process_consumer.py ## Web server If package is installed via pip, you need a file named *gunicorn_conf.py* containing somehwhere on local server: def worker_exit(server, worker): from prometheus_client import multiprocess multiprocess.mark_process_dead(worker.pid) If you cloned the repository and installed it via python setup.py install, just refer to the *gunicorn_conf.py* in the cloned repository. export BIOMAJ_CONFIG=path_to_config.yml rm -rf ..path_to/prometheus-multiproc mkdir -p ..path_to/prometheus-multiproc export prometheus_multiproc_dir=..path_to/prometheus-multiproc gunicorn -c ..path_to/gunicorn_conf.py biomaj_download.biomaj_process_web:app Web processes should be behind a proxy/load balancer, API base url /api/process A prometheus /metrics endpoint is exposed on web server 3.0.19 Replace nose by pytest 3.0.18: Normalize yaml setup with other biomaj components 3.0.17: Fix yaml load warnings 3.0.16: In case of proxy comm failure, sleep a few seconds before retry 3.0.15: Add proc name in logs for waiting and result 3.0.14: Add env var BIOMAJ_HOST_DATA_DIR to use with *docker* process executor to specify data.dir location if different between host and container (if BIOMAJ_DATA_DIR not a subdirectory of BIOMAJ_DIR for example) If variable is not set, container wil mount data.dir between host and container, else will mount BIOMAJ_HOST_DATA_DIR:data.dir 3.0.13: Fix traefik prefix 3.0.12: Update pika dependency release Add tags for traefik support 3.0.11: Catch exception for microservices if remote server is not reachable Rename package for protobuf to avoid collisions 3.0.10: README doc fixes Add dependency banks additional volumes for Docker 3.0.9: Allow local_endpoint definition per service Fix volumes for docker with dependency banks 3.0.8: Fix #1, DRMAA needs colon in front of output and error path (mandatory depending on versions) 3.0.7: fix case if process desc or type is missing in bank properties 3.0.6: disable web thread logging 3.0.5: retry in case of contact failure with proxy 3.0.4: for docker, restrict directory to bank directory and dependencies add host in prometheus stats 3.0.3: fix prometheus + gunicorn multi process add consul supervision 3.0.2: add logging info execute docker processes in biomaj micro service 3.0.1: bug fixes 3.0.0: move process management out of biomaj main package

نیازمندی

مقدار	نام
-	biomaj-core
-	biomaj-zipkin
==0.13.0	pika
-	redis
-	PyYAML
-	flask
-	python-consul
>=0.0.18	prometheus-client
-	protobuf
-	requests

نحوه نصب

نصب پکیج whl biomaj-process-3.0.9:

pip install biomaj-process-3.0.9.whl

نصب پکیج tar.gz biomaj-process-3.0.9:

pip install biomaj-process-3.0.9.tar.gz