معرفی شرکت ها

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

For programmatic upload of files to Cellencis

ویژگی	مقدار
سیستم عامل	-
نام فایل	biomage-programmatic-interface-0.0.9
نام	biomage-programmatic-interface
نسخه کتابخانه	0.0.9
نگهدارنده	[]
ایمیل نگهدارنده	[]
نویسنده	Biomage Ltd
ایمیل نویسنده	engineering@biomage.net
آدرس صفحه اصلی	https://github.com/biomage-org/programmatic_interface
آدرس اینترنتی	https://pypi.org/project/biomage-programmatic-interface/
مجوز	-

\n# biomage-programmatic-interface ### About This python package provides an easy way to create projects and upload samples into Biomage. ## Installation To install the package execute the following line: `pip install biomage-programmatic-interface` ## Usage In order to use the package you first need to create an account in Biomage (https://scp.biomage.net/) if you don't have one yet. Then the package is used in the following way: ```python import biomage_programmatic_interface as bpi # 1. Authenticate user and create a connection tunnel with the api # Default instance-url: https://api.scp.biomage.net/ connection = bpi.Connection('email', 'password', 'instance_url') # 2. Create an experiment experiment = connection.create_experiment('experiment name') # 3. Upload samples associated with the experiment experiment.upload_samples('local/path/to/samples') ``` Once the upload is complete you can navigate to [Biomage](https://scp.biomage.net/) and process your project there. ### `Connection` class The object accepts 3 parameters: 1. `email` - Biomage email 2. `password` - Biomage password 3. `instance_url` - Biomage instance url - Copy the url of the Biomage instance *excluding* `https://` - If the url is https://scp.biomage.net/ enter just the domain name: `scp.biomage.net` ## Development If you cloned the repository and want to try using your local version, do the following: - Install the local version of the pip package: ```bash cd programmatic_interface make install ``` - Now you can import the package and use your local version ```python import biomage_programmatic_interface as bpi ``` ***NOTE***: There is **NO** need to run `make install` every time you make changes to the package. When the local changes have been saved the changes will be automatically reflected. ### Running with local instance of Cellenics When creating the `connection` object set the `instance_url` to `local`. Now the programmatic interface will use your local api (https://localhost:3000) ```python import biomage_programmatic_interface as bpi conn = bpi.Connection(<YOUR EMAIL>, <YOUR PASSWORD>, 'local') ... ``` ### Running with staged environment Set the full path of the instance url (e.g. `https://api-{ENVIRONMENT NAME}.scp-staging.biomage.net/`) ```python import biomage_programmatic_interface as bpi conn = bpi.Connection(<YOUR EMAIL>, <YOUR PASSWORD>, 'https://api-{ENVIRONMENT NAME}.scp-staging.biomage.net/') ... ``` *NOTE: the url is that of the api (i.e. `api-`) and not that of the ui*

نحوه نصب

نصب پکیج whl biomage-programmatic-interface-0.0.9:

pip install biomage-programmatic-interface-0.0.9.whl

نصب پکیج tar.gz biomage-programmatic-interface-0.0.9:

pip install biomage-programmatic-interface-0.0.9.tar.gz