معرفی شرکت ها

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

Computational Biology tool for CLI use.

ویژگی	مقدار
سیستم عامل	-
نام فایل	biocli-1.0.1b1
نام	biocli
نسخه کتابخانه	1.0.1b1
نگهدارنده	[]
ایمیل نگهدارنده	[]
نویسنده	-
ایمیل نویسنده	Orkhan Shirin <orkhan.shirinow@gmail.com>
آدرس صفحه اصلی	-
آدرس اینترنتی	https://pypi.org/project/biocli/
مجوز	-

# CLI tool for Computational Biology Please read before use! Works with python version >= 3.9 For Linux users only Works with `.txt` files only. Install requirements via pip3. Make the "compute" file executable using linux terminal typing `chmod +x compute` command ## How to use Examples: ```console $ ./compute biocli -h usage: compute biocli [-h] {count,pattern,translate} positional arguments: {count,pattern,translate} count Count feature to count the nucleotides and patterns in the given DNA or RNA sequence. pattern Pattern feature for finding given pattern in the given DNA or RNA sequence. translate Translate feature to translate the given DNA sequence to RNA and vice versa. optional arguments: -h, --help show this help message and exit ``` ```console $ ./compute biocli translate dna-to-rna "sample.txt" to_file=False UGCUCCGCCGAACCAUUCAUGCGGGAUACGACUUGGAUGACAUAGGAAAUUCAUAAUUAUCGUGUCUAAGUAAUUGCAUGCAGGCUGCAA UAACGUUGUUGGCCGAGCGUAAUACAAGAUUAGCCGCUGUUGAUGCUCAUUAGACGCGUUGGUAAAUUUGACGUUCUUAUGACCCCUACG UAUAACAGAAUAGCCUCUGGUGACUUUUCUGAGCACCGAUCUCGCAAUAUAUUAGCCACUAUAUUAUCUAAGCCGAGCCAAUCAUUGAUA CACAUAGUAAUGUCAGGACGUCGAACCUAGAUUGUAUGACUCCGCUAAGGUAUUCCGAGAGACACUAGGAUACUAGAUAUAUUCCCAAAG UAAGGCGACGCCUAGUCUUUAGAGAGCGAGUAUGCCUUUGCCAAGUGUUGGAUGAGCCCGCCCCUUAAUAGGUGCUACGCUAGAGGCAAA GCAUGUGGGCGGUGGCCACACUUCAAUCAGGUGGCGAGUAGACGCUUCAGCCCGUUCGAUCUUAAGUAUCAGUAUAGGGACUCGAGUACA GUGUCCAAAUUACUGCGCUCGGUCCUAUGCUGACAAGGCGAACUCUGCAGAGAAUGGUCCGAAUUCACAUUCGGACAAUACGAUGUAGGA CCGAACAAGCACAGUUUGAUUCGCCUCGGAAGACGGUGCAACUGAAACAGUAGAUCUCCUUAUCAAUGUAGGGCGAAGUACUGCCCGCGU GAGGGCACCAGCAUCCAGUCUCGUUGCUGUUCGUAUGGGGAUCAACGGCGGGUUGUUCUUAAGAACAUCAGGAUGAGUUAAUCGAGAGUA CUGAACCGCUAUUCGACACCGCAGGUUGCGACACCAAAUUGCCUAAACAUCAACAGCCUCAAUUACCUGCUGUCCACUCGAGCUUGGGGU ACAGUGUUAUCCUUCACUUGAACGACAAGAUAAUGAACAUUGUGGACUUGCGUAUA ``` ## Project layout ```console ├── biocli ├── biocli │ ├── count.py │ ├── pattern.py │ ├── translate.py │ ├── _errors.py │ ├── _helper.py │ ├── _sequence.py │ ├── __init__.py ├── compute ``` ### Contains: DNA to RNA sequence translator RNA to DNA sequence translator Pattern matcher Pattern counter Nucleotide counter Frequency counter Sample files added. Built on top of DynaCLI by BST Labs. [Check it out!](https://github.com/BstLabs/py-dynacli)

نیازمندی

مقدار	نام
-	dynacli
=22.3.	black
=2.12.	pylint
=5.9.	isort
=1.	autoflake
=4.0.	flake8
=2.17.	pre-commit
=8.1.	mkdocs-material

زبان مورد نیاز

مقدار	نام
>=3.8	Python

نحوه نصب

نصب پکیج whl biocli-1.0.1b1:

pip install biocli-1.0.1b1.whl

نصب پکیج tar.gz biocli-1.0.1b1:

pip install biocli-1.0.1b1.tar.gz