معرفی شرکت ها

bio2bel-interpro-0.2.1

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
0.2.1
0.2.0
0.1.1
0.2.1
0.2.0
0.1.1

توضیحات

A package for converting InterPro to BEL
ویژگی مقدار
سیستم عامل -
نام فایل bio2bel-interpro-0.2.1
نام bio2bel-interpro
نسخه کتابخانه 0.2.1
نگهدارنده ['Charles Tapley Hoyt']
ایمیل نگهدارنده ['charles.hoyt@scai.fraunhofer.de']
نویسنده Charles Tapley Hoyt
ایمیل نویسنده charles.hoyt@scai.fraunhofer.de
آدرس صفحه اصلی https://github.com/bio2bel/interpro
آدرس اینترنتی https://pypi.org/project/bio2bel-interpro/
مجوز MIT License
Bio2BEL InterPro |build| |coverage| |documentation| |zenodo| ============================================================ Converts the InterPro protein families, domains, and other classes to ontological relations in BEL. Installation |pypi_version| |python_versions| |pypi_license| ------------------------------------------------------------ ``bio2bel_interpro`` can be installed easily from `PyPI <https://pypi.python.org/pypi/bio2bel_interpro>`_ with the following code in your favorite terminal: .. code-block:: sh $ python3 -m pip install bio2bel_interpro or from the latest code on `GitHub <https://github.com/bio2bel/interpro>`_ with: .. code-block:: sh $ python3 -m pip install git+https://github.com/bio2bel/interpro.git@master Setup ----- InterPro can be downloaded and populated from either the Python REPL or the automatically installed command line utility. Python REPL ~~~~~~~~~~~ .. code-block:: python >>> import bio2bel_interpro >>> interpro_manager = bio2bel_interpro.Manager() >>> interpro_manager.populate() Command Line Utility ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ .. code-block:: bash bio2bel_interpro populate Programmatic Interface ---------------------- To enrich the proteins in a BEL Graph with their InterPro entries (families, domains, sites, etc.) , use: >>> from bio2bel_interpro import enrich_proteins >>> graph = ... # get a BEL graph >>> enrich_proteins(graph) .. |build| image:: https://travis-ci.org/bio2bel/interpro.svg?branch=master :target: https://travis-ci.org/bio2bel/interpro :alt: Build Status .. |coverage| image:: https://codecov.io/gh/bio2bel/interpro/coverage.svg?branch=master :target: https://codecov.io/gh/bio2bel/interpro?branch=master :alt: Coverage Status .. |documentation| image:: http://readthedocs.org/projects/bio2bel-interpro/badge/?version=latest :target: http://bio2bel.readthedocs.io/projects/interpro/en/latest/?badge=latest :alt: Documentation Status .. |climate| image:: https://codeclimate.com/github/bio2bel/interpro/badges/gpa.svg :target: https://codeclimate.com/github/bio2bel/interpro :alt: Code Climate .. |python_versions| image:: https://img.shields.io/pypi/pyversions/bio2bel_interpro.svg :alt: Stable Supported Python Versions .. |pypi_version| image:: https://img.shields.io/pypi/v/bio2bel_interpro.svg :alt: Current version on PyPI .. |pypi_license| image:: https://img.shields.io/pypi/l/bio2bel_interpro.svg :alt: MIT License .. |zenodo| image:: https://zenodo.org/badge/98345182.svg :target: https://zenodo.org/badge/latestdoi/98345182 :alt: Zenodo DOI


نیازمندی

مقدار نام
>=2.1 networkx
>=0.13.0 pybel
<0.3.0,>=0.2.0 bio2bel
- compath-utils
- click
- sqlalchemy
- tqdm
- pandas
- flask
- flask-admin
- sphinx
- sphinx-rtd-theme
- sphinx-click
- flask
- flask-admin


نحوه نصب


نصب پکیج whl bio2bel-interpro-0.2.1:

    pip install bio2bel-interpro-0.2.1.whl


نصب پکیج tar.gz bio2bel-interpro-0.2.1:

    pip install bio2bel-interpro-0.2.1.tar.gz