معرفی شرکت ها

bio2bel-hgnc-0.3.0

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

A package for converting HGNC to BEL
ویژگی مقدار
سیستم عامل -
نام فایل bio2bel-hgnc-0.3.0
نام bio2bel-hgnc
نسخه کتابخانه 0.3.0
نگهدارنده ['Charles Tapley Hoyt']
ایمیل نگهدارنده ['cthoyt@gmail.com']
نویسنده Charles Tapley Hoyt
ایمیل نویسنده cthoyt@gmail.com
آدرس صفحه اصلی https://github.com/bio2bel/hgnc
آدرس اینترنتی https://pypi.org/project/bio2bel-hgnc/
مجوز MIT License
Bio2BEL HGNC |build| |coverage| |documentation| |zenodo| ======================================================== This package creates: - HGNC BEL namespace - HGNC gene families BEL namespace, - HGNC gene family membership BEL Script - orthology BEL script Installation |pypi_version| |python_versions| |pypi_license| ------------------------------------------------------------ ``bio2bel_hgnc`` can be installed easily from `PyPI <https://pypi.python.org/pypi/bio2bel_hgnc>`_ with the following code in your favorite terminal: .. code-block:: sh $ python3 -m pip install bio2bel_hgnc or from the latest code on `GitHub <https://github.com/bio2bel/hgnc>`_ with: .. code-block:: sh $ python3 -m pip install git+https://github.com/bio2bel/hgnc.git@master Setup ----- HGNC can be downloaded and populated from either the Python REPL or the automatically installed command line utility. Python REPL ~~~~~~~~~~~ .. code-block:: python >>> import bio2bel_hgnc >>> hgnc_manager = bio2bel_hgnc.Manager() >>> hgnc_manager.populate() Command Line Utility ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ .. code-block:: bash bio2bel_hgnc populate Citations --------- - Gray KA, *et al*. `genenames.org: the HGNC resources in 2015 <http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25361968>`_. Nucleic Acids Res. 2015 Jan;43(Database issue):D1079-85 Acknowledgements ---------------- - This package heavily relies on Andrej Konotopez's package `PyHGNC <https://github.com/lekono/pyhgnc>`_ .. |build| image:: https://travis-ci.org/bio2bel/hgnc.svg?branch=master :target: https://travis-ci.org/bio2bel/hgnc :alt: Build Status .. |coverage| image:: https://codecov.io/gh/bio2bel/hgnc/coverage.svg?branch=master :target: https://codecov.io/gh/bio2bel/hgnc?branch=master :alt: Coverage Status .. |documentation| image:: http://readthedocs.org/projects/bio2bel-hgnc/badge/?version=latest :target: http://bio2bel.readthedocs.io/projects/hgnc/en/latest/?badge=latest :alt: Documentation Status .. |climate| image:: https://codeclimate.com/github/bio2bel/hgnc/badges/gpa.svg :target: https://codeclimate.com/github/bio2bel/hgnc :alt: Code Climate .. |python_versions| image:: https://img.shields.io/pypi/pyversions/bio2bel_hgnc.svg :alt: Stable Supported Python Versions .. |pypi_version| image:: https://img.shields.io/pypi/v/bio2bel_hgnc.svg :alt: Current version on PyPI .. |pypi_license| image:: https://img.shields.io/pypi/l/bio2bel_hgnc.svg :alt: MIT License .. |zenodo| image:: https://zenodo.org/badge/DOI/10.5281/zenodo.1162644.svg :target: https://doi.org/10.5281/zenodo.1162644


نیازمندی

مقدار نام
<0.15.0,>=0.14.0 pybel
<0.4.0,>=0.3.0 bio2bel
- tqdm
- sqlalchemy
- click
- pyhgnc
- flask
- flask-admin
- sphinx
- sphinx-rtd-theme
- sphinx-click
- sphinx-autodoc-typehints
- flask
- flask-admin


نحوه نصب


نصب پکیج whl bio2bel-hgnc-0.3.0:

    pip install bio2bel-hgnc-0.3.0.whl


نصب پکیج tar.gz bio2bel-hgnc-0.3.0:

    pip install bio2bel-hgnc-0.3.0.tar.gz