معرفی شرکت ها

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

A package for parsing and storing the ExPASy Enzyme Database

ویژگی	مقدار
سیستم عامل	-
نام فایل	bio2bel-expasy-0.2.0
نام	bio2bel-expasy
نسخه کتابخانه	0.2.0
نگهدارنده	['Charles Tapley Hoyt']
ایمیل نگهدارنده	['charles.hoyt@scai.fraunhofer.de']
نویسنده	Charles Tapley Hoyt
ایمیل نویسنده	charles.hoyt@scai.fraunhofer.de
آدرس صفحه اصلی	https://github.com/bio2bel/expasy
آدرس اینترنتی	https://pypi.org/project/bio2bel-expasy/
مجوز	MIT License

Bio2BEL ExPASy |build| |coverage| |docs| |zenodo| ================================================= This repository downloads and parses the enzyme classes from the ExPASy ENZYME database Installation |pypi_version| |python_versions| |pypi_license| ------------------------------------------------------------ ``bio2bel_expasy`` can be installed easily from `PyPI <https://pypi.python.org/pypi/bio2bel_expasy>`_ with the following code in your favorite terminal: .. code-block:: sh $ python3 -m pip install bio2bel_expasy or from the latest code on `GitHub <https://github.com/bio2bel/expasy>`_ with: .. code-block:: sh $ python3 -m pip install git+https://github.com/bio2bel/expasy.git@master or check the `installation instructions <http://bio2bel.readthedocs.io/projects/expasy/en/latest/#installation>`_. Setup ----- ExPASy can be downloaded and populated from either the Python REPL or the automatically installed command line utility. Python REPL ~~~~~~~~~~~ .. code-block:: python >>> import bio2bel_expasy >>> expasy_manager = bio2bel_expasy.Manager() >>> expasy_manager.populate() Command Line Utility ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ .. code-block:: bash bio2bel_expasy populate Programmatic Interface ---------------------- To enrich the proteins in a BEL Graph with their enzyme classes, use: >>> from bio2bel_expasy import enrich_proteins >>> graph = ... # get a BEL graph >>> enrich_proteins(graph) Citations --------- Gasteiger, E., *et al.* (2003). `ExPASy: The proteomics server for in-depth protein knowledge and analysis <http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/12824418>`_. Nucleic Acids Research, 31(13), 3784–8. .. |build| image:: https://travis-ci.org/bio2bel/expasy.svg?branch=master :target: https://travis-ci.org/bio2bel/expasy :alt: Build Status .. |coverage| image:: https://codecov.io/gh/bio2bel/expasy/coverage.svg?branch=master :target: https://codecov.io/gh/bio2bel/expasy?branch=master :alt: Coverage Status .. |docs| image:: https://readthedocs.org/projects/bio2bel-expasy/badge/?version=latest :target: https://bio2bel.readthedocs.io/projects/expasy/en/latest/?badge=latest :alt: Documentation Status .. |python_versions| image:: https://img.shields.io/pypi/pyversions/bio2bel_expasy.svg :alt: Stable Supported Python Versions .. |pypi_version| image:: https://img.shields.io/pypi/v/bio2bel_expasy.svg :alt: Current version on PyPI .. |pypi_license| image:: https://img.shields.io/pypi/l/bio2bel_expasy.svg :alt: Apache 2.0 License .. |zenodo| image:: https://zenodo.org/badge/100023822.svg :target: https://zenodo.org/badge/latestdoi/100023822

نیازمندی

مقدار	نام
<0.13.0,>=0.12.0	pybel
<0.3.0,>=0.2.0	bio2bel
-	requests
-	tqdm
-	sqlalchemy
>=2.1	networkx
-	click
-	pandas
xtr	sphinx;
xtr	sphinx-rtd-theme;
xtr	sphinx-click;
xtr	flask;
xtr	flask-admin;

نحوه نصب

نصب پکیج whl bio2bel-expasy-0.2.0:

pip install bio2bel-expasy-0.2.0.whl

نصب پکیج tar.gz bio2bel-expasy-0.2.0:

pip install bio2bel-expasy-0.2.0.tar.gz