معرفی شرکت ها

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

PAST: latent feature extraction with a Prior-based self-Attention framework for Spatial Transcriptomics

ویژگی	مقدار
سیستم عامل	-
نام فایل	bio-past-1.6.0
نام	bio-past
نسخه کتابخانه	1.6.0
نگهدارنده	[]
ایمیل نگهدارنده	[]
نویسنده	Zhen Li
ایمیل نویسنده	lizhen18THU@163.com
آدرس صفحه اصلی	https://github.com/lizhen18THU/PAST
آدرس اینترنتی	https://pypi.org/project/bio-past/
مجوز	MIT License

PAST software is build on a variational graph convolutional auto-encoder designed for spatial transcriptomics which integrates prior information with Bayesian neural network, captures spatial information with self-attention mechanism and enables scalable application with ripple walk sampler strategy. PAST could effectively characterize spatial domains and facilitate various downstream analysis through integrating spatial information and reference from various sources. Besides, PAST also enable time and memory-efficient application on large datasets while preserving global spatial patterns for better performance. Importantly, PAST could also facilitate accurate annotation of spatial domains and thus provide biological insights.

نیازمندی

مقدار	نام
>=0.55.1	numba
>=1.21.5	numpy
>=1.3.4	pandas
>=1.5.3	scipy
>=1.0.2	scikit-learn
>=1.9.1	scanpy
>=1.9.1	torch

زبان مورد نیاز

مقدار	نام
>3.6.0	Python

نحوه نصب

نصب پکیج whl bio-past-1.6.0:

pip install bio-past-1.6.0.whl

نصب پکیج tar.gz bio-past-1.6.0:

pip install bio-past-1.6.0.tar.gz