معرفی شرکت ها
biceps-2.0b0.post0
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشترتوضیحات
BICePs
| ویژگی | مقدار |
|---|---|
| سیستم عامل | - |
| نام فایل | biceps-2.0b0.post0 |
| نام | biceps |
| نسخه کتابخانه | 2.0b0.post0 |
| نگهدارنده | [] |
| ایمیل نگهدارنده | [] |
| نویسنده | Robert M. Raddi, Yunhui Ge, Vincent A. Voelz |
| ایمیل نویسنده | rraddi@temple.edu, yunhui.ge@gmail.com, vvoelz@gmail.com |
| آدرس صفحه اصلی | https://biceps.readthedocs.io/en/latest/index.html |
| آدرس اینترنتی | https://pypi.org/project/biceps/ |
| مجوز | MIT |
BICePs - Bayesian Inference of Conformational Populations
=========================================================
<!-- List badges here: -->
[](https://biceps.readthedocs.io/en/latest/?badge=latest)
<!-- -->
The BICePs algorithm (Bayesian Inference of Conformational Populations)
is a statistically rigorous Bayesian inference method to reconcile
theoretical predictions of conformational state populations with sparse
and/or noisy experimental measurements and objectively compare different
models. Supported experimental observables include:
- [NMR nuclear Overhauser effect](https://en.wikipedia.org/wiki/Nuclear_Overhauser_effect) (`NOE`).
- [NMR chemical shifts](https://en.wikipedia.org/wiki/Chemical_shift) (`HA`,`NH`, `CA` and `N`).
- [J couplings](https://en.wikipedia.org/wiki/J-coupling) (both small molecules and amino acids) (`J`).
- [Hydrogen--deuterium exchange](https://en.wikipedia.org/wiki/Hydrogen–deuterium_exchange) (`HDX`).
<!--
Citation [](http://doi.org/10.1021/acs.jpcb.7b11871)
-->
Citation [](https://doi.org/10.26434/chemrxiv-2022-1b24c)
### Check our [BICePs website](https://biceps.readthedocs.io/en/latest/) for more details!
### Please check out the [theory of **BICePs**](https://biceps.readthedocs.io/en/latest/theory.html) to learn more.
Installation (in progress)
==========================
<!--
We recommend that you install `BICePs` with `conda`. :
```bash
$ conda install -c conda-forge BICePs
```
You can install also `BICePs` with `pip`, if you prefer. :
```bash
$ pip install BICePs
```
-->
<!--
Conda is a cross-platform package manager built especially for
scientific python. It will install `BICePs` along with all dependencies
from a pre-compiled binary. If you don\'t have Python or the `conda`
package manager, we recommend starting with the [Anaconda Scientific
Python distribution \<https://store.continuum.io/cshop/anaconda/\>](),
which comes pre-packaged with many of the core scientific python
packages that BICePs uses (see below), or with the [Miniconda Python
distribution](http://conda.pydata.org/miniconda.html), which is a
bare-bones Python installation.
-->
BICePs supports Python 2.7 (see [tag v1.0](https://github.com/vvoelz/biceps/releases/tag/v1.0)) or Python 3.4+ (v2.0 or greater) on Mac, Linux, and Windows.
Dependencies of BICePs
----------------------
> - [pymbar](https://pymbar.readthedocs.io) >= 4.0.1
> - [mdtraj](https://mdtraj.org) >= 1.5.0
> - matplotlib >= 2.1.2
> - numpy >= 1.14.0
> - multiprocessing
-------------------------------------------
### View [the workflow of BICePs](https://biceps.readthedocs.io/en/latest/workflow.html).
### BICePs is research software. If you make use of BICePs in scientific publications, please cite it.
# To get started, see [biceps/releases](https://github.com/vvoelz/biceps/releases) for the latest version of BICePs.
نیازمندی
| مقدار | نام |
|---|---|
| >=0.28 | cython |
| >=1.7.0 | numpy |
| - | natsort |
| - | matplotlib |
| - | scikit-learn |
| - | pandas |
| - | scipy |
| - | tqdm |
| >=4.0.1 | pymbar |
| - | mdtraj |
زبان مورد نیاز
| مقدار | نام |
|---|---|
| >=3.7 | Python |
نحوه نصب
نصب پکیج whl biceps-2.0b0.post0:
pip install biceps-2.0b0.post0.whl
نصب پکیج tar.gz biceps-2.0b0.post0:
pip install biceps-2.0b0.post0.tar.gz