معرفی شرکت ها

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

Grep-like tool for retrieving matching sequence records from a FASTA file

ویژگی	مقدار
سیستم عامل	-
نام فایل	better-fasta-grep-1.0.4
نام	better-fasta-grep
نسخه کتابخانه	1.0.4
نگهدارنده	[]
ایمیل نگهدارنده	[]
نویسنده	Felix Thalen, Clemens Mauksch
ایمیل نویسنده	felix.thalen@uni-goettingen.de, clemens.mauksch@uni-goettingen.de
آدرس صفحه اصلی	https://github.com/fethalen/better_fasta_grep
آدرس اینترنتی	https://pypi.org/project/better-fasta-grep/
مجوز	GPL 3

Better FASTA Grep ----------------- <img src="https://gitlab.com/fethalen/bfg/raw/master/images/bfg.png" alt="BFG logo - a pair of binoculars" align="right" width = "20%"/> Better FASTA Grep, or BFG for short, is a Grep-like utility for retrieving matching sequence records from a FASTA file. Given one or more patterns and a FASTA file, it searches the file for matching headers and or sequences and outputs any matching headers, sequences, or both. ## Features * Search headers, sequences, or both * Search via regular expressions or plain strings * Case-insensitive search * Select non-matching sequence records * Count the number of matches * Display line numbers in the result * Sequence records, not individual lines, are selected * Multi-line sequences are treated as singular units * Flexible output options: output headers, sequences, or both <img src="https://gitlab.com/fethalen/bfg/raw/master/images/bfg_screenshot_1.png" alt="BFG Screenshot" /> A screenshot of running BFG under macOS Mojave. ## Quick installation The easiest way to install this program is via `pip`: ```bash pip install better_fasta_grep ``` You can then launch `bfg` using _one_ of the following commands: ```bash bfg --help better_fasta_grep --help # equivalent ``` ## [Documentation](https://github.com/fethalen/better_fasta_grep/wiki) 1. [Introduction](https://github.com/fethalen/better_fasta_grep/wiki#1-introduction) 2. [Installation](https://github.com/fethalen/better_fasta_grep/wiki#2-installation) 3. [Invoking `bfg`](https://github.com/fethalen/better_fasta_grep/wiki#3-invoking-bfg) 4. [Regular Expressions](https://github.com/fethalen/better_fasta_grep/wiki#4-regular-expressions) 5. [Input Data](https://github.com/fethalen/better_fasta_grep/wiki#5-input-data) 6. [Usage](https://github.com/fethalen/better_fasta_grep/wiki#6-usage) © Department for Animal Evolution and Biodiversity 2019

زبان مورد نیاز

مقدار	نام
>=3.6	Python

نحوه نصب

نصب پکیج whl better-fasta-grep-1.0.4:

pip install better-fasta-grep-1.0.4.whl

نصب پکیج tar.gz better-fasta-grep-1.0.4:

pip install better-fasta-grep-1.0.4.tar.gz