معرفی شرکت ها


bento-tools-2.0.0a0


Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

A toolkit for subcellular analysis of spatial transcriptomics data
ویژگی مقدار
سیستم عامل -
نام فایل bento-tools-2.0.0a0
نام bento-tools
نسخه کتابخانه 2.0.0a0
نگهدارنده []
ایمیل نگهدارنده []
نویسنده Clarence Mah
ایمیل نویسنده ckmah@ucsd.edu
آدرس صفحه اصلی -
آدرس اینترنتی https://pypi.org/project/bento-tools/
مجوز BSD-2-Clause
[![PyPI version](https://badge.fury.io/py/bento-tools.svg)](https://badge.fury.io/py/bento-tools) [![codecov](https://codecov.io/gh/ckmah/bento-tools/branch/master/graph/badge.svg?token=XVHDKNDCDT)](https://codecov.io/gh/ckmah/bento-tools) [![Documentation Status](https://readthedocs.org/projects/bento-tools/badge/?version=latest)](https://bento-tools.readthedocs.io/en/latest/?badge=latest) ![PyPI - Downloads](https://img.shields.io/pypi/dm/bento-tools) [![GitHub stars](https://badgen.net/github/stars/ckmah/bento-tools)](https://GitHub.com/Naereen/ckmah/bento-tools) # Bento Bento is a Python toolkit for performing subcellular analysis of spatial transcriptomics data. The package is part of the [Scverse ecosystem](https://scverse.org/packages/#ecosystem). Check out the [documentation](https://bento-tools.readthedocs.io/en/latest/) for installation instructions, tutorials, and API. Cite [our preprint](https://doi.org/10.1101/2022.06.10.495510) if you use Bento in your work. Thanks! <img src="docs/source/_static/tutorial_img/bento_tools.png" alt="Bento Workflow" width="800"> --- [![GitHub license](https://img.shields.io/github/license/ckmah/bento-tools.svg)](https://github.com/ckmah/bento-tools/blob/master/LICENSE)


نیازمندی

مقدار نام
>=0.8,<0.9 anndata
>=5.0,<6.0 astropy
>=0.10.0,<0.11.0 geopandas
>=3.2,<4.0 matplotlib
>=0.8.1,<0.9.0 matplotlib-scalebar
>=0.12.0,<0.13.0 pygeos
>=1.9.1,<2.0.0 scanpy
>=1.7.0,<2.0.0 scipy
>=0.12.1,<0.13.0 seaborn
>=1.8.2,<2.0.0 Shapely
>=4.1.2,<5.0.0) Sphinx[docs]
>=2021.3.14,<2022.0.0) sphinx-autobuild[docs]
>=1.0.0,<2.0.0) sphinx-book-theme[docs]
>=0.10.1,<0.11.0) sphinx-gallery[docs]
>=0.13.2,<0.14.0 statsmodels
>=4.64.0,<5.0.0 tqdm
>=0.6.1,<0.7.0 UpSetPlot
>=1.7.0,<2.0.0 emoji
>=0.7.0,<0.8.0 tensorly
>=1.3.0,<2.0.0 rasterio
>=8.0,<9.0 ipywidgets
>=1.2.0,<2.0.0 decoupler
>=2.3.0,<3.0.0 MiniSom
>=0.8.1,<0.9.0 kneed
>=0.7.3,<0.8.0 adjustText
>=0.13.0,<0.14.0 sparse
>=1.5.3,<2.0.0 pandas
==1.4.0 xgboost
>=0.17.1,<0.18.0) myst-nb[docs]
>=0.3.0,<0.4.0) sphinx_design[docs]


زبان مورد نیاز

مقدار نام
>=3.8,<3.10 Python


نحوه نصب


نصب پکیج whl bento-tools-2.0.0a0:

    pip install bento-tools-2.0.0a0.whl


نصب پکیج tar.gz bento-tools-2.0.0a0:

    pip install bento-tools-2.0.0a0.tar.gz