معرفی شرکت ها


bedshift-1.1.1


Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

BED file perturbations
ویژگی مقدار
سیستم عامل -
نام فایل bedshift-1.1.1
نام bedshift
نسخه کتابخانه 1.1.1
نگهدارنده []
ایمیل نگهدارنده []
نویسنده Aaron Gu
ایمیل نویسنده ag5ym@virginia.edu
آدرس صفحه اصلی https://bedshift.databio.org
آدرس اینترنتی https://pypi.org/project/bedshift/
مجوز BSD2
# Bedshift Docs: bedshift.databio.org Install from PyPi: `pip install bedshift` Install from local repository: `pip install .` ## Command line Run with: ``` bedshift -l tests/hg38.chrom.sizes -b tests/test.bed ``` See `bedshift -h` for parameters. ## Python ```py import bedshift bedshifter = bedshift.Bedshift('tests/test.bed', 'hg38.chrom.sizes') bedshifter.all_perturbations(addrate=0.3, addmean=320.0, addstdev=20.0, shiftrate=0.3, shiftmean=-10.0, shiftstdev=120.0, cutrate=0.1, mergerate=0.11, droprate=0.03) # can also run single operations: shift, add, cut, merge, drop bedshifter.to_bed('test_output.bed') ``` ## Development Run tests (from this directory): ``` python -m unittest ``` Double check the output files to see if the regions make sense. build docs:


نیازمندی

مقدار نام
- logmuse
- pandas
- numpy
- pyranges


نحوه نصب


نصب پکیج whl bedshift-1.1.1:

    pip install bedshift-1.1.1.whl


نصب پکیج tar.gz bedshift-1.1.1:

    pip install bedshift-1.1.1.tar.gz