معرفی شرکت ها

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

Putative annotation of metabolites for mass spectrometry-based metabolomics datasets.

ویژگی	مقدار
سیستم عامل	-
نام فایل	beamspy-1.1.0
نام	beamspy
نسخه کتابخانه	1.1.0
نگهدارنده	[]
ایمیل نگهدارنده	[]
نویسنده	Ralf Weber
ایمیل نویسنده	r.j.weber@bham.ac.uk
آدرس صفحه اصلی	https://github.com/computational-metabolomics/beamspy
آدرس اینترنتی	https://pypi.org/project/beamspy/
مجوز	GPLv3

BEAMSpy - Birmingham mEtabolite Annotation for Mass Spectrometry (Python package) ================================================================================== |Version| |Py versions| |Git| |Bioconda| |Build Status| |Build Status (AppVeyor)| |License| |RTD doc| |codecov| |mybinder| BEAMSpy (Birmingham mEtabolite Annotation for Mass Spectrometry) is a Python package that includes several automated and seamless computational modules that are applied to putatively annotate metabolites detected in untargeted ultra (high) performance liquid chromatography-mass spectrometry or untargeted direct infusion mass spectrometry metabolomic assays. All reported metabolites are annotated to level 2 or 3 of the Metabolomics Standards Initiative (MSI) reporting standards (Metabolomics. 2007 Sep; 3(3): 211–221. `doi: 10.1007/s11306-007-0082-2 <https://doi.org/10.1007/s11306-007-0082-2>`_). The package is highly flexible to suit the diversity of sample types studied and mass spectrometers applied in untargeted metabolomics studies. The user can use the standard reference files included in the package or can develop their own reference files. - `Documentation (Read the Docs) <https://beamspy.readthedocs.io/en/latest/>`_ - `Bug reports <https://github.com/computational-metabolomics/beamspy/issues>`_ Quick installation ------------------- Conda_ ~~~~~~~ 1. Install `Miniconda <https://docs.conda.io/en/latest/miniconda.html>`_. Follow the steps described `here <https://docs.conda.io/projects/conda/en/latest/user-guide/install>`__. 2. Run the following commands to install BEAMSpy. Windows-64, Linux-64 and OSx :: $ conda create -n beamspy beamspy -c conda-forge -c bioconda -c computational-metabolomics $ activate beamspy Linux-64 and OSx :: $ conda create -n beamspy beamspy -c conda-forge -c bioconda -c computational-metabolomics $ source activate beamspy Usage ------------------------ Command line interface (CLI) ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ :: $ beamspy --help Graphical user interface (GUI) ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ :: $ beamspy start-gui Bug reports ------------------------ Please report any bugs that you find `here <https://github.com/computational-metabolomics/beamspy/issues>`__. Or fork the repository on `GitHub <https://github.com/computational-metabolomics/beamspy/>`_ and create a pull request (PR). We welcome all contributions, and we will help you to make the PR if you are new to `git <https://guides.github.com/activities/hello-world/>`_. Credits ------- - `Team (University of Birmingham and EMBL-EBI) <https://more.bham.ac.uk/beams/team/>`__ **Code base** - Ralf J. M. Weber (r.j.weber@bham.ac.uk) - `University of Birmingham (UK) <https://www.birmingham.ac.uk/staff/profiles/biosciences/weber-ralf.aspx>`__ License ------------------------ Released under the GNU General Public License v3.0 (see `LICENSE <https://github.com/computational-metabolomics/beamspy/blob/master/LICENSE>`_) .. |Build Status| image:: https://github.com/computational-metabolomics/beamspy/workflows/beamspy/badge.svg :target: https://github.com/computational-metabolomics/beamspy/actions .. |Build Status (AppVeyor)| image:: https://img.shields.io/appveyor/ci/RJMW/beamspy.svg?style=flat&maxAge=3600&label=AppVeyor :target: https://ci.appveyor.com/project/RJMW/beamspy .. |Py versions| image:: https://img.shields.io/pypi/pyversions/beamspy.svg?style=flat&maxAge=3600 :target: https://pypi.python.org/pypi/beamspy/ .. |Version| image:: https://img.shields.io/pypi/v/beamspy.svg?style=flat&maxAge=3600 :target: https://pypi.python.org/pypi/beamspy/ .. |Git| image:: https://img.shields.io/badge/repository-GitHub-blue.svg?style=flat&maxAge=3600 :target: https://github.com/computational-metabolomics/beamspy .. |Bioconda| image:: https://img.shields.io/badge/install%20with-bioconda-brightgreen.svg?style=flat&maxAge=3600 :target: http://bioconda.github.io/recipes/beamspy/README.html .. |License| image:: https://img.shields.io/badge/License-GPL%20v3-blue.svg :target: https://www.gnu.org/licenses/gpl-3.0.html .. |RTD doc| image:: https://img.shields.io/badge/documentation-RTD-71B360.svg?style=flat&maxAge=3600 :target: https://beamspy.readthedocs.io/en/latest/ .. |codecov| image:: https://codecov.io/gh/computational-metabolomics/beamspy/branch/master/graph/badge.svg :target: https://codecov.io/gh/computational-metabolomics/beamspy .. |mybinder| image:: https://mybinder.org/badge_logo.svg :target: https://mybinder.org/v2/gh/computational-metabolomics/beamspy/master?filepath=notebooks .. _pip: https://pip.pypa.io/ .. _Conda: https://conda.io/en/latest/

زبان مورد نیاز

مقدار	نام
>=3.7	Python

نحوه نصب

نصب پکیج whl beamspy-1.1.0:

pip install beamspy-1.1.0.whl

نصب پکیج tar.gz beamspy-1.1.0:

pip install beamspy-1.1.0.tar.gz