معرفی شرکت ها

baredSC-1.1.1

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
1.1.1
1.1.0
1.0.0

توضیحات

baredSC: Bayesian Approach to Retreive Expression Distribution of Single Cell
ویژگی مقدار
سیستم عامل -
نام فایل baredSC-1.1.1
نام baredSC
نسخه کتابخانه 1.1.1
نگهدارنده []
ایمیل نگهدارنده []
نویسنده Lucille Lopez-Delisle, Jean-Baptiste Delisle
ایمیل نویسنده lucille.delisle@epfl.ch
آدرس صفحه اصلی https://github.com/lldelisle/baredSC
آدرس اینترنتی https://pypi.org/project/baredSC/
مجوز GPLv3
baredSC ======= [![PyPI Version](https://img.shields.io/pypi/v/baredsc.svg?style=plastic)](https://pypi.org/project/baredSC/) [![bioconda-badge](https://img.shields.io/conda/vn/bioconda/baredSC.svg?style=plastic)](https://anaconda.org/bioconda/baredsc) [![DOI](https://zenodo.org/badge/370966963.svg)](https://zenodo.org/badge/latestdoi/370966963) baredSC (Bayesian Approach to Retreive Expression Distribution of Single Cell) is a tool that uses a Monte-Carlo Markov Chain to estimate a confidence interval on the probability density function (PDF) of expression of one or two genes from single-cell RNA-seq data. It uses the raw counts and the total number of UMI for each cell. The PDF is approximated by a number of 1d or 2d gaussians provided by the user. The likelihood is estimated using the asumption that the raw counts follow a Poisson distribution of parameter equal to the proportion of mRNA for the gene in the cell multiplied by the total number of UMI identified in this cell. Documentation ------------- Visit [our documentation](https://baredsc.readthedocs.io) to see the possible options and follow the tutorials. Citation -------- If you are using baredSC, please cite our [biorxiv paper](https://doi.org/10.1101/2021.05.26.445740).


زبان مورد نیاز

مقدار نام
>=3.7.*, <4 Python


نحوه نصب


نصب پکیج whl baredSC-1.1.1:

    pip install baredSC-1.1.1.whl


نصب پکیج tar.gz baredSC-1.1.1:

    pip install baredSC-1.1.1.tar.gz