معرفی شرکت ها

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

BacDive-API - Programmatic Access to the BacDive Database

ویژگی	مقدار
سیستم عامل	-
نام فایل	bacdive-0.2
نام	bacdive
نسخه کتابخانه	0.2
نگهدارنده	[]
ایمیل نگهدارنده	[]
نویسنده	Julia Koblitz
ایمیل نویسنده	julia.koblitz@dsmz.de
آدرس صفحه اصلی	https://bacdive.dsmz.de/
آدرس اینترنتی	https://pypi.org/project/bacdive/
مجوز	-

# BacDive API Using the BacDive API requires registration. Registration is free but the usage of BacDive data is only permitted when in compliance with the BacDive terms of use. See [About BacDive](https://bacdive.dsmz.de/about) for details. Please register [here](https://api.bacdive.dsmz.de/login). The Python package can be initialized using your login credentials: ```python import bacdive client = bacdive.BacdiveClient('name@mail.example', 'password') # the search method fetches all BacDive-IDs matching your query # and returns the number of IDs found count = client.search(taxonomy='Bacillus subtilis subtilis') print(count, 'strains found.') # the retrieve method lets you iterate over all strains # and returns the full entry as dict # Entries can be further filtered using a list of keys (e.g. ['keywords']) for strain in client.retrieve(): print(strain) ``` ## Example queries: ```python # Search by BacDive-IDs (either semicolon separated or as list): query = {"id": 24493} query = {"id": "24493;12;132485"} query = {"id": [24493, 12, 132485]} # Search by culture collection number query = {"culturecolno": "DSM 26640"} # Search by taxonomy (either as full name or as list): # With genus name, species epithet (optional), and subspecies (optional). query = {"taxonomy": "Bacillus subtilis subsp. subtilis"} query = {"taxonomy": ("Escherichia", "coli")} # Search by sequence accession numbers: query = {"16s": "AF000162"} # 16S sequence query = {"genome": "GCA_006094295"} # genome sequence # run query client.search(**query) ``` ## Filtering Results from the `retrieve` Method of both clients can be further filtered. The result contains a list of matched keyword dicts: ```python filter=['keywords', 'culture collection no.'] result = client.retrieve(filter) print({k:v for x in result for k,v in x.items()}) ``` The printed result will look like this: ```python {'1161': [{'keywords': ['human pathogen', 'Bacteria']}, {'culture collection no.': 'DSM 4393, pC194, SB202'}], '1162': [{'keywords': ['human pathogen', 'Bacteria']}, {'culture collection no.': 'DSM 4514, ATCC 37015, BD170, NCIB 11624, ' 'pUB110'}], '1163': [{'keywords': ['human pathogen', 'Bacteria']}, {'culture collection no.': 'DSM 4554, ATCC 37128, BGSC 1E18, pE194'}], '1164': [{'keywords': 'Bacteria'}, {'culture collection no.': 'DSM 4750, 1E7, BGSC 1E7, pE194-cop6'}], ... ```

نیازمندی

مقدار	نام
-	python-keycloak
>=2.25.1	requests
>=1.26.5	urllib3

زبان مورد نیاز

مقدار	نام
>=3.6	Python

نحوه نصب

نصب پکیج whl bacdive-0.2:

pip install bacdive-0.2.whl

نصب پکیج tar.gz bacdive-0.2:

pip install bacdive-0.2.tar.gz