معرفی شرکت ها

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

submit hundreds of jobs to slurm automatically.

ویژگی	مقدار
سیستم عامل	-
نام فایل	autosbatch-0.2.2
نام	autosbatch
نسخه کتابخانه	0.2.2
نگهدارنده	[]
ایمیل نگهدارنده	[]
نویسنده	Jianhua Wang
ایمیل نویسنده	jianhua.mert@gmail.com
آدرس صفحه اصلی	https://github.com/Jianhua-Wang/autosbatch
آدرس اینترنتی	https://pypi.org/project/autosbatch/
مجوز	MIT

# autosbatch [![pypi](https://img.shields.io/pypi/v/autosbatch.svg)](https://pypi.org/project/autosbatch/) [![python](https://img.shields.io/pypi/pyversions/autosbatch.svg)](https://pypi.org/project/autosbatch/) [![Build Status](https://github.com/Jianhua-Wang/autosbatch/actions/workflows/dev.yml/badge.svg)](https://github.com/Jianhua-Wang/autosbatch/actions/workflows/dev.yml) [![codecov](https://codecov.io/gh/Jianhua-Wang/autosbatch/branch/main/graphs/badge.svg)](https://codecov.io/github/Jianhua-Wang/autosbatch) [![License: MIT](https://img.shields.io/badge/License-MIT-yellow.svg)](https://opensource.org/licenses/MIT) [![PyPI download month](https://img.shields.io/pypi/dm/autosbatch.svg)](https://pypi.org/project/autosbatch/) submit hundreds of jobs to slurm automatically * Documentation: <https://Jianhua-Wang.github.io/autosbatch> * GitHub: <https://github.com/Jianhua-Wang/autosbatch> * PyPI: <https://pypi.org/project/autosbatch/> * Free software: MIT ## Features Sometimes, it's quite inconvenient when we submit hundreds of jobs to slurm. For example, one needs to align RNA-seq data from one hundred samples. He may start with a bash script that takes the fastq of one sample and write sbatch scripts which execute `bash align.sh sample.fq` multiple times. If he wants to run 50 samples at the same time, he should write 50 sbatch scripts and each script contains two align commands. Manually managing these sbatch scripts is inconvenient. autosbatch is very helpful for submitting slurm jobs automatically and it's just like the `multiprocessing.Pool`. * Automatically submit hundreds of jobs to Slurm with a few code. * The same usage as `multiprocessing.Pool`. * Provide command line tool for people who are not familiar with Python. ## TODO * Support gpu allocation * Support MPI jobs ## Credits This package was created with [Cookiecutter](https://github.com/audreyr/cookiecutter) and the [waynerv/cookiecutter-pypackage](https://github.com/waynerv/cookiecutter-pypackage) project template.

نیازمندی

مقدار	نام
>=22.3.0	black
>=1.0.1,<2.0.0	bump2version
>=3.9.2,<4.0.0	flake8
>=1.6.0,<2.0.0	flake8-docstrings
>=8.0.4,<9.0.0	ipywidgets
>=5.8.0,<6.0.0	isort
>=3.1.2,<4.0.0	jinja2
>=1.4.2,<2.0.0	mkdocs
>=0.4.1,<0.5.0	mkdocs-autorefs
>=4.0.3,<5.0.0	mkdocs-include-markdown-plugin
>=8.5.11,<9.0.0	mkdocs-material
>=1.1.1,<2.0.0	mkdocs-material-extensions
>=0.19.1,<0.20.0	mkdocstrings[python]
>=0.900,<0.901	mypy
>=20.3.1,<21.0.0	pip
>=2.12.0,<3.0.0	pre-commit
>=6.2.4,<7.0.0	pytest
>=2.12.0,<3.0.0	pytest-cov
>=13.3.1,<14.0.0	rich
>=0.10.2,<0.11.0	toml
>=3.20.1,<4.0.0	tox
>=3.3.0,<4.0.0	twine
>=0.7.0,<0.8.0	typer
>=20.2.2,<21.0.0	virtualenv

زبان مورد نیاز

مقدار	نام
>=3.8,<3.12	Python

نحوه نصب

نصب پکیج whl autosbatch-0.2.2:

pip install autosbatch-0.2.2.whl

نصب پکیج tar.gz autosbatch-0.2.2:

pip install autosbatch-0.2.2.tar.gz