معرفی شرکت ها
autorad-0.2.6
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشترتوضیحات
Radiomics-related modules for extraction and experimenting
| ویژگی | مقدار |
|---|---|
| سیستم عامل | - |
| نام فایل | autorad-0.2.6 |
| نام | autorad |
| نسخه کتابخانه | 0.2.6 |
| نگهدارنده | [] |
| ایمیل نگهدارنده | [] |
| نویسنده | Piotr Woznicki |
| ایمیل نویسنده | piotr.a.woznicki@gmail.com |
| آدرس صفحه اصلی | https://github.com/pwoznicki/AutoRadiomics |
| آدرس اینترنتی | https://pypi.org/project/autorad/ |
| مجوز | Apache 2.0 |
<p align="center">
<br>
<img src="docs/images/logo.png" alt="AutoRadiomics">
</p>
[](https://opensource.org/licenses/Apache-2.0)
[](https://autoradiomics.readthedocs.io)
[](https://github.com/pwoznicki/AutoRadiomics/commits/main)
[](https://codecov.io/gh/pwoznicki/AutoRadiomics)
## Framework for simple experimentation with radiomics features
| <p align="center"><a href="https://pwoznicki-autoradiomics-autoradwebappapp-streamlit-demo-w7ej7a.streamlit.app"> Streamlit Share | <p align="center"><a href="https://hub.docker.com/repository/docker/pwoznicki/autorad"> Docker | <p align="center"><a href="https://pypi.org/project/autorad/"> Python |
| --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- | ------------------------------------------------------------------------------------------------------------- | -------------------------------------------------------------------------------------------------------------- |
| <p align="center"><img src="https://github.com/pwoznicki/AutoRadiomics/raw/main/docs/images/streamlit.png" /></p> | <p align="center"><img src="https://github.com/pwoznicki/AutoRadiomics/raw/main/docs/images/docker.png"/></p> | <p align="center"><img src="https://github.com/pwoznicki/AutoRadiomics/raw/main/docs/images/python.png" /></p> |
| <p align="center"><a href="https://pwoznicki-autoradiomics-autoradwebappapp-streamlit-demo-w7ej7a.streamlit.app"> **Demo** | `docker run -p 8501:8501 -v <your_data_dir>:/data -it pwoznicki/autorad:latest` | `pip install -U autorad` |
## Download desktop app (experimental)
| <p align="center"><a href="https://drive.google.com/uc?export=download&id=1fZyBeMvFUZXn7ND_FgeQRV3W68Dn6zZb"> Windows 10 | <p align="center"><a href="https://drive.google.com/uc?export=download&id=1N3JLv2h00Pp8XfwWXbBWvr7OnQ2h9pNu"> MacOS 11 (x64) | <p align="center"><a href="https://drive.google.com/uc?export=download&id=1SDG7J5ucwd4Nkq-5fAeArLKvHTcD045M"> Ubuntu 20.04 |
| ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ | ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- | -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- |
| <p align="center"><img src="https://github.com/pwoznicki/AutoRadiomics/raw/main/docs/images/windows.png" /></p> | <p align="center"><img src="https://github.com/pwoznicki/AutoRadiomics/raw/main/docs/images/macos.png"/></p> | <p align="center"><img src="https://github.com/pwoznicki/AutoRadiomics/raw/main/docs/images/ubuntu.png" /></p> |
## Installation from source
```bash
git clone https://github.com/pwoznicki/AutoRadiomics.git
cd AutoRadiomics
pip install -e .
```
## Getting started
Tutorials can be found in the [examples](./examples/) directory:
- [Binary classification](./examples/example_WORC.ipynb)
Documentation is available at [autoradiomics.readthedocs.io](https://autoradiomics.readthedocs.io/en/latest/).
## Web application
To use the application, make sure you have its dependencies installed:
```bash
pip install -e ".[app]"
```
The application can be started from the root directory with:
```bash
streamlit run autorad/webapp/app.py
```
By default it willl run at http://localhost:8501/.
<br/><br/>
For more information about AutoRadiomics, please read [our paper](https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fradi.2022.919133/full):
```
AutoRadiomics: A Framework for Reproducible Radiomics Research;
P Woznicki, F Laqua, T Bley, B Baeßler;
Frontiers in Radiology, 22
```
Please cite it if you're using the framework for your research.
نیازمندی
| مقدار | نام |
|---|---|
| ==3.0.1 | pyradiomics |
| ==1.2.0 | scikit-learn |
| ==2.1.1.2 | SimpleITK |
| ==1.4.2 | pandas |
| ==1.9 | scipy |
| ==6.0 | pyyaml |
| ==0.13.2 | statsmodels |
| ==2.0.1 | mlflow |
| ==3.2.1 | nibabel |
| ==3.5 | matplotlib |
| ==0.4.2 | xnat |
| ==4.62.3 | tqdm |
| >=0.2.0 | pqdm |
| ==0.3 | Boruta |
| ==1.6.0 | xgboost |
| ==0.9.1 | imbalanced-learn |
| ==2.10.0 | optuna |
| ==5.5 | plotly |
| ==0.41 | shap |
| ==0.19 | scikit-image |
| ~=1.15 | streamlit |
| ~=1.14 | jupytext |
| ~=6.2 | coverage |
| - | great-expectations |
| ~=6.2 | pytest |
| ~=6.36 | hypothesis |
| ~=22.10 | black |
| ~=4.0 | flake8 |
| ~=5.10 | isort |
| ~=2.17 | pre-commit |
| ~=1.15 | streamlit |
| ~=1.14 | jupytext |
| ==1.4.2 | mkdocs |
| ==8.5.10 | mkdocs-material |
| ==0.19.0 | mkdocstrings[python] |
| ==1.4.2 | mkdocs |
| ==8.5.10 | mkdocs-material |
| ==0.19.0 | mkdocstrings[python] |
زبان مورد نیاز
| مقدار | نام |
|---|---|
| >=3.9 | Python |
نحوه نصب
نصب پکیج whl autorad-0.2.6:
pip install autorad-0.2.6.whl
نصب پکیج tar.gz autorad-0.2.6:
pip install autorad-0.2.6.tar.gz