معرفی شرکت ها

astir-0.1.4

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
0.1.4
0.1.3
0.1.0
0.0.9
0.0.11
0.0.10
0.1.4
0.1.3
0.1.0
0.0.9
0.0.11
0.0.10

توضیحات

-
ویژگی مقدار
سیستم عامل -
نام فایل astir-0.1.4
نام astir
نسخه کتابخانه 0.1.4
نگهدارنده []
ایمیل نگهدارنده []
نویسنده Jinyu Hou, Sunyun Lee, Michael Geuenich, Kieran Campbell
ایمیل نویسنده kierancampbell@lunenfeld.ca
آدرس صفحه اصلی https://github.com/camlab-bioml/astir
آدرس اینترنتی https://pypi.org/project/astir/
مجوز GPLv2
=================================================================================== astir - Automated cell identity from single-cell multiplexed imaging and proteomics =================================================================================== |Build Status| |PyPI| |Code Style| .. |Build Status| image:: https://travis-ci.com/camlab-bioml/astir.svg?branch=master :target: https://travis-ci.org/camlab-bioml/astir .. |Code Style| image:: https://img.shields.io/badge/code%20style-black-black :target: https://github.com/python/black .. |PyPI| image:: https://img.shields.io/badge/pypi-v2.1-orange :target: https://pypi.org/project/pypi/ ``astir`` is a modelling framework for the assignment of cell type across a range of single-cell technologies such as Imaging Mass Cytometry (IMC). ``astir`` is built using `pytorch <https://pytorch.org/>`_ and uses recognition networks for fast minibatch stochastic variational inference. Key applications: - Automated assignment of cell type and state from highly multiplexed imaging and proteomic data - Diagnostic measures to check quality of resulting type and state inferences - Ability to map new data to cell types and states trained on existing data using recognition neural networks - A range of plotting and data loading utilities .. image:: https://www.camlab.ca/img/astir.png :align: center :alt: automated single-cell pathology Getting started --------------------- See the full `documentation <https://astir.readthedocs.io/en/latest>`_ and check out the `tutorials <https://astir.readthedocs.io/en/latest/tutorials/index.html>`_. An interactive vignette can be found as a Google colab notebook as part of the following repository. https://github.com/camlab-bioml/Astir-Vignette Authors --------------------- | Jinyu Hou, Sunyun Lee, Michael Geuenich, Kieran Campbell | Lunenfeld-Tanenbaum Research Institute & University of Toronto


نیازمندی

مقدار نام
- torch
- pandas
- numpy
- nbformat
- pyyaml
- sklearn
- argparse
- matplotlib
- loompy
- tqdm
- anndata
- rootpath
- nbconvert
- seaborn
- jupyter-client
- ipykernel
- ipython
- h5py
- FlowCytometryTools
- fastcluster
- sphinx
- sphinx-autodoc-typehints
- sphinx-rtd-theme
- autodocsumm
- nbsphinx
- nbsphinx-link
- tables
- typeguard
- mypy


نحوه نصب


نصب پکیج whl astir-0.1.4:

    pip install astir-0.1.4.whl


نصب پکیج tar.gz astir-0.1.4:

    pip install astir-0.1.4.tar.gz