معرفی شرکت ها

asmscan-lstm-1.0.0

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
1.0.0
1.0.0

توضیحات

Bidirectional LSTM model for detection of amyloid signaling motifs.
ویژگی مقدار
سیستم عامل -
نام فایل asmscan-lstm-1.0.0
نام asmscan-lstm
نسخه کتابخانه 1.0.0
نگهدارنده []
ایمیل نگهدارنده []
نویسنده Jakub Gałązka
ایمیل نویسنده kubagalv2@gmail.com
آدرس صفحه اصلی https://github.com/jakub-galazka/asmscan-lstm
آدرس اینترنتی https://pypi.org/project/asmscan-lstm/
مجوز GNU General Public License v3 (GPLv3)
# ASMscan-LSTM ![GitHub License](https://img.shields.io/github/license/jakub-galazka/asmscan-lstm) Bidirectional LSTM model for detection of amyloid signaling motifs (ASMs). ## Installation ```bash pip install asmscan-lstm ``` ## Usage ```python from asmscanlstm import ASMscanLSTM aa_seqs = [ "MEGRASGSARIYQAGGDQYIEE", "VSLRAGAHDGGRIYQAVGDQYIYE", "HASGHGRVFQSAGDQHITEH" ] model = ASMscanLSTM() pred, frags = model.predict(aa_seqs) ``` ## References ASMscan-LSTM model is part of the [ASMscan](https://github.com/wdyrka-pwr/ASMscan) project: * Not yet published. ASMscan project is an extension of the ASMs analysis conducted with the [PCFG-CM](https://git.e-science.pl/wdyrka/pcfg-cm) model: * W. Dyrka, M. Gąsior-Głogowska, M. Szefczyk, N. Szulc, "Searching for universal model of amyloid signaling motifs using probabilistic context-free grammars", *BMC Bioinformatics*, 22, 222, 2021. * W. Dyrka, M. Pyzik, F. Coste, H. Talibart, "Estimating probabilistic context-free grammars for proteins using contact map constraints", *PeerJ*, 7, e6559, 2019.


نیازمندی

مقدار نام
==2.11.0 tensorflow
==1.6 progress


زبان مورد نیاز

مقدار نام
>=3.7 Python


نحوه نصب


نصب پکیج whl asmscan-lstm-1.0.0:

    pip install asmscan-lstm-1.0.0.whl


نصب پکیج tar.gz asmscan-lstm-1.0.0:

    pip install asmscan-lstm-1.0.0.tar.gz