معرفی شرکت ها

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

toolkit to process routine operation on gff3, vcf and fasta files

ویژگی	مقدار
سیستم عامل	-
نام فایل	anvage-0.1.1
نام	anvage
نسخه کتابخانه	0.1.1
نگهدارنده	[]
ایمیل نگهدارنده	[]
نویسنده	Pierre-Edouard GUERIN
ایمیل نویسنده	pierre-edouard.guerin@cefe.cnrs.fr
آدرس صفحه اصلی	https://github.com/Grelot/anvage
آدرس اینترنتی	https://pypi.org/project/anvage/
مجوز	MIT

# ANVAGE [![Build Status](https://travis-ci.com/Grelot/anvage.svg?branch=main)](https://travis-ci.com/Grelot/anvage) ANnotation Variants GEnome is a toolkit software to perform routine operations that involve VCF, GFF3 and FASTA genome files. # usage ``` anvage select --vcf tests/data/sample.vcf \ --genome tests/data/genome.fasta \ --annotation tests/data/genome.gff3 \ --selectionAnnotationType CDS \ --output_prefix res ``` ``` anvage synonymous --vcf tests/data/sample.vcf \ --genome tests/data/genome.fasta \ --annotation tests/data/genome.gff3 \ --output_prefix res ``` ``` anvage flank --vcf tests/data/sample.vcf \ --genome tests/data/genome.fasta \ --windowsSize 25 \ --output_prefix res ``` https://github.com/laurabenestan/BLAST/blob/master/flanking_sequence.py

نیازمندی

مقدار	نام
-	argparse
-	numpy
-	biopython
-	bcbio-gff
-	pyfaidx
-	gffutils
-	PyVCF

نحوه نصب

نصب پکیج whl anvage-0.1.1:

pip install anvage-0.1.1.whl

نصب پکیج tar.gz anvage-0.1.1:

pip install anvage-0.1.1.tar.gz