معرفی شرکت ها

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

ml and single cell utils.

ویژگی	مقدار
سیستم عامل	-
نام فایل	anutils-0.3.1
نام	anutils
نسخه کتابخانه	0.3.1
نگهدارنده	[]
ایمیل نگهدارنده	[]
نویسنده	Aaron Ning
ایمیل نویسنده	aaronning98@gmail.com
آدرس صفحه اصلی	https://github.com/AaronNing/anutils
آدرس اینترنتی	https://pypi.org/project/anutils/
مجوز	MIT

anutils ======= ML and single cell analysis utils. installation ------------ :: pip install anutils **NOTE**: To use ``anutils.scutils.sc_cuda``, you need to install rapids first. see `rapids.ai <https://rapids.ai/start.html>`__ for details. For example, to install rapids on a linux machine with cuda 11, you can run: .. code:: bash pip install cudf-cu11 dask-cudf-cu11 --extra-index-url=https://pypi.nvidia.com pip install cuml-cu11 --extra-index-url=https://pypi.nvidia.com pip install cugraph-cu11 --extra-index-url=https://pypi.nvidia.com usage ----- general utils: ``anutils.*`` ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ e.g., reload module .. code:: python import sys sys.path.append('/path/to/some/packaege/') import some_package # change some_package.sub_module.func, recursive reload needed from anutils import rreload rreload(some_package, max_depth=2) single cell utils: ``anutils.scutils.*`` ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ plotting ^^^^^^^^ .. code:: python from anutils import scutils as scu # a series of embeddings grouped by disease status scu.pl.embeddings(adata, basis='X_umap', groupby='disease_status', **kwargs) # kwargs for sc.pl.embedding # enhanced dotplot with groups in hierarchical order scu.pl.dotplot(adata, var_names, groupby, **kwargs) # kwargs for sc.pl.dotplot cuda-accelerated scanpy functions ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^ NOTE: to use these functions, you need to install rapids first. see `installation <#installation>`__ for details. .. code:: python from anutils.scutils import sc_cuda as cusc # 10-100 times faster than `scanpy.tl.leiden` cusc.sc.leiden(adata, resolution=0.5, key_added='leiden_0.5') # 10-100 times faster than `scib.metrics.silhouette` cusc.sb.silhouette(adata, group_key, embed) machine learning utils: ----------------------- .. code:: python import anutils.mlutils as ml # to be added

نحوه نصب

نصب پکیج whl anutils-0.3.1:

pip install anutils-0.3.1.whl

نصب پکیج tar.gz anutils-0.3.1:

pip install anutils-0.3.1.tar.gz