معرفی شرکت ها

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

aleimi is a python package for conformational analysis of small molecules

ویژگی	مقدار
سیستم عامل	-
نام فایل	aleimi-0.0.0a3
نام	aleimi
نسخه کتابخانه	0.0.0a3
نگهدارنده	[]
ایمیل نگهدارنده	[]
نویسنده	Alejandro Martínez León
ایمیل نویسنده	ale94mleon@gmail.com
آدرس صفحه اصلی	https://github.com/ale94mleon/aleimi
آدرس اینترنتی	https://pypi.org/project/aleimi/
مجوز	Apache License 2.0

Here I need to provied a correct documentation. =============================================== Coded with MOPAC2016 (Version: 21.329L) Now you should be able to use the command line without problems: `aleimi -h` And get: .. code-block:: bash positional arguments: suppl The path were the molecule(s) is(are) optional arguments: -h, --help show this help message and exit -p PARAMS, --params PARAMS Parameters to run ALEIMI How to use it ------------- It should be simple. Let's assume that you have in `~/my_project/mols` a batch of molecules (and nothing more); it doesn't matter the format (.pdb, .mol, .pdbqt, .smi, etc.), `aleimi` will try to handled. And also you would like to pass some parameters because you don't like the default ones. Then you have a text file like `~/my_project/my_awesome_params.txt`. Then it should as easy as call .. code-block:: bash aleimi ~/my_project/mols -p ~/my_project/my_awesome_params.txt And all the magic will be done! -p, --params option ------------------- This option will control the parameters of the functions: .. code-block:: python aleimi.tools.mopac aleimi.boltzmann.main aleimi.extractor.main A default param file will be filled with keyword = value lines, '#' at the beginning will be interpreted as comment lines and empty lines will be discarded. could be (in this case there is not need to specified because are the default options) like: .. code-block:: python # For Mopac mopacExecutablePath = '/opt/mopac/MOPAC2016.exe' # For Boltzmann Bd_rmsd = 1.0 Bd_E = 0.0 BOutPath = True # For extractor energy_cut = 2, conformer_cut = 0, engine = 'psi4', machine = 'smaug', mkdir = True, jobsh = True, You could also add some extra keywords that will pass to the `templates.INPUT` class that is in charge to construct the input files for the QM package. But this part is very specific and probably you will need to make some changes in the code that adjust to your necessities.

نیازمندی

مقدار	نام
-	numpy
-	pandas
-	rdkit
-	rmsd
-	pytest

زبان مورد نیاز

مقدار	نام
<=3.11,>=3.8	Python

نحوه نصب

نصب پکیج whl aleimi-0.0.0a3:

pip install aleimi-0.0.0a3.whl

نصب پکیج tar.gz aleimi-0.0.0a3:

pip install aleimi-0.0.0a3.tar.gz