معرفی شرکت ها

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

A package to automatically access the inverted repeats of archived plastid genomes

ویژگی	مقدار
سیستم عامل	-
نام فایل	airpg-1.1.4
نام	airpg
نسخه کتابخانه	1.1.4
نگهدارنده	[]
ایمیل نگهدارنده	[]
نویسنده	Michael Gruenstaeudl, Tilman Mehl
ایمیل نویسنده	m.gruenstaeudl@fu-berlin.de, tilmanmehl@zedat.fu-berlin.de
آدرس صفحه اصلی	https://github.com/michaelgruenstaeudl/airpg
آدرس اینترنتی	https://pypi.org/project/airpg/
مجوز	GPLv3

*airpg*: Automatically accessing the inverted repeats of archived plastid genomes ================================================================================= [![Build Status](https://travis-ci.com/michaelgruenstaeudl/airpg.svg?branch=master)](https://travis-ci.com/michaelgruenstaeudl/airpg) [![PyPI status](https://img.shields.io/pypi/status/airpg.svg)](https://pypi.python.org/pypi/airpg/) [![PyPI pyversions](https://img.shields.io/pypi/pyversions/airpg.svg)](https://pypi.python.org/pypi/airpg/) [![PyPI version shields.io](https://img.shields.io/pypi/v/airpg.svg)](https://pypi.python.org/pypi/airpg/) [![PyPI license](https://img.shields.io/pypi/l/airpg.svg)](https://pypi.python.org/pypi/airpg/) A Python package for automatically accessing the inverted repeats of thousands of plastid genomes stored on NCBI Nucleotide ## INSTALLATION To get the most recent stable version of *airpg*, run: pip install airpg Or, alternatively, if you want to get the latest development version of *airpg*, run: pip install git+https://github.com/michaelgruenstaeudl/airpg.git ## EXAMPLE USAGE ### [Tutorial 1](https://github.com/michaelgruenstaeudl/airpg/tree/main/airpg/tutorials/tutorial1.md): Very short survey (runtime ca. 5 min.; for the impatient) Survey of all plastid genomes of flowering plants submitted to NCBI Nucleotide within the past 10 days. ### [Tutorial 2](https://github.com/michaelgruenstaeudl/airpg/tree/main/airpg/tutorials/tutorial2.md): Short survey (runtime ca. 15 min.; for testing) Survey of all plastid genomes of flowering plants submitted to NCBI Nucleotide within the current month. ### [Tutorial 3](https://github.com/michaelgruenstaeudl/airpg/tree/main/airpg/tutorials/tutorial3.md): Medium survey (runtime ca. 5 hours) Survey of all plastid genomes of flowering plants submitted to NCBI Nucleotide in 2019 only. Note: The results of this survey are available on Zenodo via DOI [10.5281/zenodo.4335906](https://zenodo.org/record/4335906) ### [Tutorial 4](https://github.com/michaelgruenstaeudl/airpg/tree/main/airpg/tutorials/tutorial4.md): Full survey (runtime ca. 19 hours; with explanations) Survey of all plastid genomes of flowering plants submitted to NCBI Nucleotide from January 2000 until, and including, December 2020. Note: The results of this survey are available on Zenodo via DOI [10.5281/zenodo.4335906](https://zenodo.org/record/4335906)  ## CHANGELOG See [`CHANGELOG.md`](CHANGELOG.md) for a list of recent changes to the software.

نیازمندی

مقدار	نام
-	biopython
-	ete3
-	entrezpy
-	pandas
-	fuzzywuzzy
-	coloredlogs
-	python-Levenshtein

زبان مورد نیاز

مقدار	نام
>=3.6	Python

نحوه نصب

نصب پکیج whl airpg-1.1.4:

pip install airpg-1.1.4.whl

نصب پکیج tar.gz airpg-1.1.4:

pip install airpg-1.1.4.tar.gz