معرفی شرکت ها

aind-exaspim-pipeline-utils-0.2.2

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
0.2.2
0.2.1
0.2.0
0.1.6
0.1.5
0.1.4
0.2.2
0.2.1
0.2.0
0.1.6
0.1.5
0.1.4

توضیحات

AIND exaSPIM pipeline utilities.
ویژگی مقدار
سیستم عامل -
نام فایل aind-exaspim-pipeline-utils-0.2.2
نام aind-exaspim-pipeline-utils
نسخه کتابخانه 0.2.2
نگهدارنده []
ایمیل نگهدارنده []
نویسنده Allen Institute for Neural Dynamics
ایمیل نویسنده -
آدرس صفحه اصلی -
آدرس اینترنتی https://pypi.org/project/aind-exaspim-pipeline-utils/
مجوز MIT
# exaSPIM pipeline utils [![License](https://img.shields.io/badge/license-MIT-brightgreen)](LICENSE) ![Code Style](https://img.shields.io/badge/code%20style-black-black) Code repository to be installed in exaSPIM processing capsules. Wrapper code for ImageJ automation. ## ImageJ wrapper module The ImageJ wrapper module contains Fiji macro templates and wrapper code to automatically run interest point detection and interest point based registration in the Code Ocean capsule. This functionality is set as the main entry point of the package if the whole package is invoked on the command line or the `aind_exaspim_pipeline` command is run. ```bash python -m aind_exaspim_pipeline_utils ``` ## Installation To use the software, in the root directory, run ```bash pip install -e . ``` To develop the code, run ```bash pip install -e .[dev] ``` ## Contributing ### Linters and testing There are several libraries used to run linters, check documentation, and run tests. - Please test your changes using the **coverage** library, which will run the tests and log a coverage report: ```bash coverage run -m unittest discover && coverage report ``` - Use **interrogate** to check that modules, methods, etc. have been documented thoroughly: ```bash interrogate . ``` - Use **flake8** to check that code is up to standards (no unused imports, etc.): ```bash flake8 . ``` - Use **black** to automatically format the code into PEP standards: ```bash black . ``` - Use **isort** to automatically sort import statements: ```bash isort . ``` ### Pull requests For internal members, please create a branch. For external members, please fork the repository and open a pull request from the fork. We'll primarily use [Angular](https://github.com/angular/angular/blob/main/CONTRIBUTING.md#commit) style for commit messages. Roughly, they should follow the pattern: ```text <type>(<scope>): <short summary> ``` where scope (optional) describes the packages affected by the code changes and type (mandatory) is one of: - **build**: Changes that affect build tools or external dependencies (example scopes: pyproject.toml, setup.py) - **ci**: Changes to our CI configuration files and scripts (examples: .github/workflows/ci.yml) - **docs**: Documentation only changes - **feat**: A new feature - **fix**: A bugfix - **perf**: A code change that improves performance - **refactor**: A code change that neither fixes a bug nor adds a feature - **test**: Adding missing tests or correcting existing tests ### Documentation To generate the rst files source files for documentation, run ```bash sphinx-apidoc -o doc_template/source/ src ``` Then to create the documentation HTML files, run ```bash sphinx-build -b html doc_template/source/ doc_template/build/html ``` More info on sphinx installation can be found [here](https://www.sphinx-doc.org/en/master/usage/installation.html).


نیازمندی

مقدار نام
- argschema
- psutil
- black
- coverage
- flake8
- interrogate
- isort
- Sphinx
- furo


زبان مورد نیاز

مقدار نام
>=3.8 Python


نحوه نصب


نصب پکیج whl aind-exaspim-pipeline-utils-0.2.2:

    pip install aind-exaspim-pipeline-utils-0.2.2.whl


نصب پکیج tar.gz aind-exaspim-pipeline-utils-0.2.2:

    pip install aind-exaspim-pipeline-utils-0.2.2.tar.gz