معرفی شرکت ها
aiida-cp2k-ng-1.0.0b2
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشترتوضیحات
The CP2K plugin for the AiiDA workflow and provenance engine.
| ویژگی | مقدار |
|---|---|
| سیستم عامل | - |
| نام فایل | aiida-cp2k-ng-1.0.0b2 |
| نام | aiida-cp2k-ng |
| نسخه کتابخانه | 1.0.0b2 |
| نگهدارنده | [] |
| ایمیل نگهدارنده | [] |
| نویسنده | Ole Schütt, Edward Ditler, Aliaksandr Yakutovich, Patrick Seewald, Tiziano Müller, Andreas Glöss, Leonid Kahle |
| ایمیل نویسنده | ole.schuett@cp2k.org |
| آدرس صفحه اصلی | https://github.com/aiidateam/aiida-cp2k |
| آدرس اینترنتی | https://pypi.org/project/aiida-cp2k-ng/ |
| مجوز | MIT License |
# AiiDA CP2K
[](https://travis-ci.com/dev-zero/aiida-cp2k) [](https://codecov.io/gh/dev-zero/aiida-cp2k)
**The CP2K plugin for the AiiDA workflow and provenance engine.**
# Installation
If you use `pip`, you can install it as:
```
pip install aiida-cp2k
```
# Features
Following the philosophy to _''enable without getting in the way''_, this plugin provides access to all of CP2K's capabilities through a small set of well-tested features:
- A full [CP2K input](https://manual.cp2k.org) has to be provided as a nested Python dictionary ([example](./test/test_dft.py)):
```
params = {'FORCE_EVAL': {'METHOD': 'Quickstep', 'DFT': { ... }}}
calc.use_parameters(ParameterData(dict=params))
```
- Section parameters are stored as key `_` in the dictionary:
```
xc_section = {'XC_FUNCTIONAL': {'_': 'LDA'}}
```
- Repeated sections are stored as a list:
```
kind_section = [{'_': 'H', 'BASIS_SET': 'DZVP-MOLOPT-GTH', 'POTENTIAL': 'GTH-LDA'},
{'_': 'O', 'BASIS_SET': 'DZVP-MOLOPT-GTH', 'POTENTIAL': 'GTH-LDA'}]
```
- Most data files (basis sets, pseudo potentials, VdW, etc.) are auto-discovered from CP2K's [data directory](https://github.com/cp2k/cp2k/tree/master/cp2k/data).
```
dft_section = {'BASIS_SET_FILE_NAME': 'BASIS_MOLOPT', ...}
```
- Additional data files can be added as AiiDA SinglefileData ([example](test/test_mm.py)):
```
water_pot = SinglefileData(file="/tmp/water.pot")
calc.use_file(water_pot, linkname="water_pot")
```
- The start geometry can be provided as AiiDA StructureData ([example](./test/test_dft.py)):
```
atoms = ase.build.molecule('H2O', vacuum=2.0)
calc.use_structure(StructureData(ase=atoms))
```
- Alternatively the start geometry can be contained in the CP2K input ([example](./test/test_no_struct.py)):
```
coord_section = {' ': ['H 2.0 2.0 2.737166',
'H 2.0 2.0 2.000000']},
```
- For restarting a calculation a parent folder can be attached ([example](./test/test_restart.py)):
```
calc2.use_parent_folder(calc1.out.remote_folder)
```
- By default only the output and restart file (if present) are retrieved. Additional files are retrieved upon request ([example](test/test_mm.py)):
```
settings = {'additional_retrieve_list': ["*.cube"]}
calc.use_settings(ParameterData(dict=settings))
```
- The final geometry is extracted from the restart file (if present) and stored in AiiDA ([example](./test/test_geopt.py)):
```
print(calc.out.output_structure)
```
- From the CP2K output only the #warnings and final energy are parsed ([example](./test/test_mm.py)):
```
print(calc.res.nwarnings, calc.res.energy, calc.res.energy_units)
```
- The calculation is considered failed if #warnings can not be found ([example](./test/test_failure.py)).
- The conversion of geometries between AiiDA and CP2K has a precision of at least 1e-10 Ångström ([example](./test/test_precision.py)).
- The Python code complies with the [Flake8](http://flake8.pycqa.org) coding conventions.
# Testing
Every commit and pull request is automatically tested by [TravisCI](https://travis-ci.org/cp2k/aiida-cp2k/).
To run the tests locally install [Docker](https://docs.docker.com/engine/installation/) and execute the following commands:
```
git clone https://github.com/cp2k/aiida-cp2k
docker build -t aiida_cp2k_test aiida-cp2k
docker run -it --init aiida_cp2k_test pytest -v
```
نیازمندی
| مقدار | نام |
|---|---|
| ==1.0.0b2 | aiida-core |
| - | ase |
| >=2019.04.14 | regex |
| ==1.14.4 | pre-commit |
| ==1.2.0 | pgtest |
| ==4.4.1 | pytest |
نحوه نصب
نصب پکیج whl aiida-cp2k-ng-1.0.0b2:
pip install aiida-cp2k-ng-1.0.0b2.whl
نصب پکیج tar.gz aiida-cp2k-ng-1.0.0b2:
pip install aiida-cp2k-ng-1.0.0b2.tar.gz