معرفی شرکت ها
aiida-bigdft-0.2.6
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشترتوضیحات
Aiida plugin for BigDFT code
| ویژگی | مقدار |
|---|---|
| سیستم عامل | - |
| نام فایل | aiida-bigdft-0.2.6 |
| نام | aiida-bigdft |
| نسخه کتابخانه | 0.2.6 |
| نگهدارنده | [] |
| ایمیل نگهدارنده | [] |
| نویسنده | The BigDFT Team |
| ایمیل نویسنده | bigdft-developers@lists.launchpad.net |
| آدرس صفحه اصلی | https://github.com/BigDFT-group/aiida-bigdft-plugin |
| آدرس اینترنتی | https://pypi.org/project/aiida-bigdft/ |
| مجوز | MIT |
[](https://travis-ci.org/BigDFT-group/aiida-bigdft-plugin)
[](https://coveralls.io/github/BigDFT-group/aiida-bigdft-plugin?branch=master)
[](http://aiida-bigdft.readthedocs.io/)
[](https://badge.fury.io/py/aiida-bigdft)
# aiida-bigdft
Aiida plugin for BigDFT code.
This is a simple plugin to integrate bigdft computation in an AiiDA workflow. Input file is generated using PyBigDFT tools, and output is returned as a dict, using the LogFile feature of PyBigDFT. Both futile and PyBigDFT are included in this plugin, BigDFT itself is not needed.
This plugin is the default output of the
[AiiDA plugin cutter](https://github.com/aiidateam/aiida-plugin-cutter),
intended to help developers get started with their AiiDA plugins.
## Features
* Create input files and specify command line options via a python dictionary and `BigDFTParameters`:
```python
d = { 'ignore-case': True }
BigDFTParameters = DataFactory('bigdft')
bigdft_parameters = {}
bigdft_parameters["dft"] = { "ixc": "LDA", "itermax": "5" }
bigdft_parameters["output"] = { 'orbitals': 'binary' }
inputs['parameters'] = BigDFTParameters(dict=bigdft_parameters)
```
* Run computation and retrieve output files (by default : logfile, time.yaml, forces, can be extended to retrieve any geenrated file):
```python
inputs['extra_retrieved_files'] = List()
inputs['extra_retrieved_files'].set_list([["./data*/*", ".", 2]])
result = run(CalculationFactory('bigdft'), **inputs)
#or asynchronously
future = submit(CalculationFactory('bigdft'), **inputs)
```
* load back YAML logfile and turn it into a python dict (through PyBigDFT utilities) to analyze results
```python
#only if run asynchronously, load results from database first after completion
result=load_node(future.pk).outputs
logfile = result['bigdft_logfile'].logfile
print (logfile['Energy (Hartree)'])
```
## Installation
```shell
pip install aiida-bigdft
verdi quicksetup # better to set up a new profile, or run reentry scan
verdi plugin list aiida.calculations # should now show your calclulation plugins
```
## Usage
Here goes a complete example of how to submit a test calculation using this plugin.
A quick demo of how to submit a calculation:
```shell
verdi daemon start # make sure the daemon is running
cd examples
verdi run submit.py # submit test calculation
verdi process list -a # check status of calculation
```
The plugin also includes verdi commands to inspect its data types:
```shell
verdi data bigdft list
verdi data bigdft export <PK>
```
## Development
```shell
git clone https://github.com/BigDFT-group/aiida-bigdft-plugin .
cd aiida-bigdft-plugin
pip install -e .[pre-commit,testing] # install extra dependencies
pre-commit install # install pre-commit hooks
pytest -v # discover and run all tests
```
See the [developer guide](http://aiida-bigdft.readthedocs.io/en/latest/developer_guide/index.html) for more information.
## License
MIT
## Contact
bigdft-developers@lists.launchpad.net
نیازمندی
| مقدار | نام |
|---|---|
| <2.0.0,>=1.1.1 | aiida-core |
| - | six |
| - | voluptuous |
| - | sphinx |
| ==1.11.0 | pre-commit |
| ==0.27.0 | yapf |
| ==0.12.11 | prospector |
| ==1.9.4 | pylint |
| ==1.2.0 | pgtest |
| >=0.31 | wheel |
| - | coverage |
| <5.0.0,>=3.6.3 | pytest |
| <5.0.0,>=2.6.1 | pytest-cov |
نحوه نصب
نصب پکیج whl aiida-bigdft-0.2.6:
pip install aiida-bigdft-0.2.6.whl
نصب پکیج tar.gz aiida-bigdft-0.2.6:
pip install aiida-bigdft-0.2.6.tar.gz