معرفی شرکت ها

aidd-codebase-0.2.0

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

High-level codebase for deep learning development in drug discovery.
ویژگی مقدار
سیستم عامل -
نام فایل aidd-codebase-0.2.0
نام aidd-codebase
نسخه کتابخانه 0.2.0
نگهدارنده []
ایمیل نگهدارنده []
نویسنده Peter Hartog
ایمیل نویسنده peter.hartog@hotmail.nl
آدرس صفحه اصلی https://github.com/aidd-msca/aidd-codebase
آدرس اینترنتی https://pypi.org/project/aidd-codebase/
مجوز MIT
# AIDD Codebase ![PyPI](https://img.shields.io/pypi/v/aidd-codebase) ![PyPI](https://img.shields.io/pypi/pyversions/aidd-codebase) ![PyPI](https://img.shields.io/github/license/aidd-msca/aidd-codebase) [![Open In Colab](https://colab.research.google.com/assets/colab-badge.svg)](https://colab.research.google.com/drive/1jlyEd1yxhvFCN82YqEFI82q2n0k_y06F?usp=sharing) A high-level codebase for deep learning development in drug discovery applications using PyTorch-Lightning. ## Dependencies The codebase requires the following additional dependencies - CUDA >= 11.4 - PyTorch >= 1.9 - Pytorch-Lightning >= 1.5 - RDKit - Optionally supports: tensorboard and/or wandb ## Installation The codebase can be installed from PyPI using `pip`, or your package manager of choice, with ```bash $ pip install aidd-codebase ``` ## Usage 1. __*Configuration*__: The coding framework has a number of argument dataclasses in the file *arguments.py*. This file contains all standard arguments for each of the models. Because they are dataclasses, you can easily adapt them to your own needs. <br> Does your Seq2Seq adaptation need an extra argument? Import the Seq2SeqArguments from arguments.py, create your own dataclass which inherits it and add your extra argument. <br> <br> *It is important to note that the order of supplying arguments to a script goes as follows:* <br> - --flags override config.yaml <br> - config.yaml overrides default values in arguments.py <br> - default values from arguments.py are used when no other values are supplied<br> At the end, it stores all arguments in config.yaml <br><br> 2. __*Use*__: The coding framework has four main parts: <br> - utils - data_utils - models - interpretation These parts should be used &nbsp; 3. __*File Setup*__: The setup of the files in the system is best used as followed:<br> coding_framework<br> |-- ..<br> ESR X<br> |-- project 1<br> |-- data<br> |-- ..<br> |-- Arguments.py<br> |-- config.yaml<br> |-- main.py<br> |-- datamodule.py<br> |-- pl_framework.py<br> ## Contributors All fellows of the AIDD consortium have contributed to the packaged. ## Code of Conduct Everyone interacting in the codebase, issue trackers, chat rooms, and mailing lists is expected to follow the [PyPA Code of Conduct](https://www.pypa.io/en/latest/code-of-conduct/).


نیازمندی

مقدار نام
>=2.6,<3.0 tensorboard
>=0.12.16,<0.13.0 wandb


زبان مورد نیاز

مقدار نام
>=3.7,<4.0 Python


نحوه نصب


نصب پکیج whl aidd-codebase-0.2.0:

    pip install aidd-codebase-0.2.0.whl


نصب پکیج tar.gz aidd-codebase-0.2.0:

    pip install aidd-codebase-0.2.0.tar.gz