معرفی شرکت ها


acryo-0.1.0


Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

An extensible cryo-EM/ET toolkit for Python.
ویژگی مقدار
سیستم عامل -
نام فایل acryo-0.1.0
نام acryo
نسخه کتابخانه 0.1.0
نگهدارنده []
ایمیل نگهدارنده []
نویسنده Hanjin Liu
ایمیل نویسنده liuhanjin-sc@g.ecc.u-tokyo.ac.jp
آدرس صفحه اصلی -
آدرس اینترنتی https://pypi.org/project/acryo/
مجوز BSD 3-Clause
# acryo An extensible cryo-EM/ET toolkit for Python. Currently only the subtomogram averaging part is implemented. The purpose of this library is to make data analysis on cryo-EM/ET more available for scientists. ### Highlights 1. Out-of-core and parallel processing by `SubtomogramLoader`. It uses [dask](https://github.com/dask/dask) to make full use of CPU. ![](images/task-graph.png) 2. Alignment algorithms are highly extensible by inheriting `BaseAlignmentModel` for the most low-level implementation or `TomographyInput` for extension at more practical-level. You can customize pre-processing, alignment function and easily extend it to support multi- reference alignment. 3. Concise representation of subtomograms, using `numpy.ndarray` for positions and `scipy.spatial.transform.Rotation` for orientation. 4. Tomogram simulation using `TomogramSimulator`. 5. Masked PCA clustering. ### Install ```bash pip install acryo -U ```


نیازمندی

مقدار نام
>=1.21 numpy
>=1.7.3 scipy
>=0.16 polars
>=2021.6.0 dask
>=4.1.1 typing-extensions


زبان مورد نیاز

مقدار نام
>=3.8 Python


نحوه نصب


نصب پکیج whl acryo-0.1.0:

    pip install acryo-0.1.0.whl


نصب پکیج tar.gz acryo-0.1.0:

    pip install acryo-0.1.0.tar.gz