معرفی شرکت ها

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

A comprehensive, opinionated plant variant calling pipeline in Snakemake

ویژگی	مقدار
سیستم عامل	-
نام فایل	acanthophis-1.0.0rc2
نام	acanthophis
نسخه کتابخانه	1.0.0rc2
نگهدارنده	[]
ایمیل نگهدارنده	[]
نویسنده	Dr. K. D. Murray
ایمیل نویسنده	foss@kdmurray.id.au
آدرس صفحه اصلی	https://github.com/kdm9/acanthophis
آدرس اینترنتی	https://pypi.org/project/acanthophis/
مجوز	-

# Acanthophis A reusable, comprehensive, opinionated plant variant calling pipeline in Snakemake Until I write the documentation, please see [the example workflow](example/). It should contain a fully working example workflow. ![Acanthophis, the most beautiful and badass of snakes](.github/logo.jpg) ## Installation & Use ```bash # create conda env, activate it conda create -n someproject python snakemake pip conda activate someproject # install acanthophis itself pip install acanthophis # generate boilerplate acanthophis-init /path/to/someproject/ # edit config.yml to suit your project vim config.yml # run snakemake snakemake -j 16 -p --use-conda --conda-frontend mamba --ri # or on a cluster, see acanthophis-init --list-available-profiles snakemake --profile ./ebio-cluster/ ``` ## About & Authors This is an amalgamation of several pipelines developed between the [Weigel Group, MPI DB, Tübingen, DE](https://weigelworld.org), the [Warthmann Group, IAEA/FAO PBGL, Seibersdorf, AT](http://warthmann.com) and the [Borevitz Group, ANU, Canberra, AU](https://borevitzlab.anu.edu.au). This amalgamation authored by Dr. K. D. Murray, original code primary by K. D. Murray, Norman Warthmann, and Ilja Bezrukov, with contributions from others at the aforementioned institutes.

زبان مورد نیاز

مقدار	نام
>=3.7	Python

نحوه نصب

نصب پکیج whl acanthophis-1.0.0rc2:

pip install acanthophis-1.0.0rc2.whl

نصب پکیج tar.gz acanthophis-1.0.0rc2:

pip install acanthophis-1.0.0rc2.tar.gz