معرفی شرکت ها

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

AACR Project GENIE ETL

ویژگی	مقدار
سیستم عامل	-
نام فایل	aacrgenie-9.0.1
نام	aacrgenie
نسخه کتابخانه	9.0.1
نگهدارنده	[]
ایمیل نگهدارنده	[]
نویسنده	Thomas Yu
ایمیل نویسنده	thomas.yu@sagebionetworks.org
آدرس صفحه اصلی	https://github.com/Sage-Bionetworks/Genie
آدرس اینترنتی	https://pypi.org/project/aacrgenie/
مجوز	MIT

![genie banner](https://raw.githubusercontent.com/Sage-Bionetworks/Genie/master/genie_banner.png) # AACR Project GENIE [![PyPi](https://img.shields.io/pypi/v/aacrgenie.svg?style=for-the-badge&label=PyPi&logo=PyPi)](https://pypi.org/project/aacrgenie) [![Docker Automated](https://img.shields.io/docker/automated/sagebionetworks/genie.svg?style=for-the-badge&logo=docker)](https://hub.docker.com/r/sagebionetworks/genie) [![GitHub CI](https://img.shields.io/github/workflow/status/Sage-Bionetworks/Genie/build.svg?&style=for-the-badge&logo=github)](https://github.com/nlpsandbox/nlpsandbox-client) ## Introduction This repository documents code used to gather, QC, standardize, and analyze data uploaded by institutes participating in AACR's Project GENIE (Genomics, Evidence, Neoplasia, Information, Exchange). ## Dependencies These are tools or packages you will need, to be able to reproduce these results: - Python 3.7 or higher - `pip install -r requirements.txt` - [bedtools](https://bedtools.readthedocs.io/en/latest/content/installation.html) ## File Validator ``` pip install aacrgenie genie -v ``` This will install all the necessary components for you to run the validator locally on all of your files, including the Synapse client. Please view the help to see how to run to validator. ``` genie validate -h genie validate data_clinical_supp_SAGE.txt SAGE ``` ## Contributing Please view [contributing guide](CONTRIBUTING.md) to learn how to contribute to the GENIE package.

نیازمندی

مقدار	نام
>=2.7.0	synapseclient
<1.5.0,>=1.0	pandas
>=0.11.3	httplib2
>=3.12.0	pycryptodome
>=5.1	PyYAML
>=3.0.4	chardet
==0.0.115	pyranges
<=1.22.2	numpy

زبان مورد نیاز

مقدار	نام
<3.10,>=3.7	Python

نحوه نصب

نصب پکیج whl aacrgenie-9.0.1:

pip install aacrgenie-9.0.1.whl

نصب پکیج tar.gz aacrgenie-9.0.1:

pip install aacrgenie-9.0.1.tar.gz