معرفی شرکت ها

Wigman-1.0.0

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
1.0.0
1.0.0

توضیحات

A package to plot genomic scores
ویژگی مقدار
سیستم عامل OS Independent
نام فایل Wigman-1.0.0
نام Wigman
نسخه کتابخانه 1.0.0
نگهدارنده []
ایمیل نگهدارنده []
نویسنده Amin Mahpour
ایمیل نویسنده amin.mgh.harvard@gmail.com
آدرس صفحه اصلی https://github.com/AminMahpour/Wigman
آدرس اینترنتی https://pypi.org/project/Wigman/
مجوز -
<img src="Docs/Images/BBS.png" width="100" height="100" /> Wigman documentation ==================== [![Build Status](https://travis-ci.org/AminMahpour/Wigman.svg?branch=master)](https://travis-ci.org/AminMahpour/Wigman) [![Codacy Badge](https://api.codacy.com/project/badge/Grade/f6a4d63a2ad542668a70fbab55b320b2)](https://www.codacy.com/app/AminMahpour/Wigman?utm_source=github.com&amp;utm_medium=referral&amp;utm_content=AminMahpour/Wigman&amp;utm_campaign=Badge_Grade) [![compatible Badge](https://img.shields.io/badge/Compatible-3.6-red.svg)](https://www.python.org/downloads/release/python-360/) [![License: GPL v2](https://img.shields.io/badge/License-GPL%20v2-blue.svg)](LICENSE) Generate heatmap files from BigWig data. ## Example ### Run the script: In order to run the plotting script, you need a config "instruction" file. The file should look like the following template: ``` Bed/Wig/pdf filename min max step colormap title description ``` My config.txt contains the following: ``` bed hg19/tata_plus.bed 50 50 TATA-Plus bed hg19/tata_minus.bed 50 50 TATA-Minus bw hg19.100way.phyloP100way.bw -4 4.02 2 BuRd PhyloP Conservation Score bw hg19.100way.phastCons.bw 0 1.02 0.5 Reds PhastCons Element Conservation bw ENCFF000SLA.bigWig 0 50.2 25 Hot K562 Base Overlap Signal bw ENCFF000SPQ.bigWig 0 20.2 10 Hot HeLa Base Overlap Signal bw GSM1480321_K562_GROcap_wTAP_plus.bigWig 0 10.2 5 Reds Plus Read bw GSM1480321_K562_GROcap_wTAP_minus.bigWig -10 0.5 5 Blues Minus Read pdf tata_profile.png size ``` Then run the following command: ``` main.py config.txt ``` ![Sample Image](Docs/Images/tata_profile.png "Wigman sample output")


زبان مورد نیاز

مقدار نام
>=3.6 Python


نحوه نصب


نصب پکیج whl Wigman-1.0.0:

    pip install Wigman-1.0.0.whl


نصب پکیج tar.gz Wigman-1.0.0:

    pip install Wigman-1.0.0.tar.gz