معرفی شرکت ها

TruSD-0.0.6b1

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
0.0.6b1
0.0.6
0.0.5
0.0.4
0.0.6b1
0.0.6
0.0.5
0.0.4

توضیحات

TruSD co-infers selection coefficients and genetic drift from allele trajectories using a maximum-likelihood framework.
ویژگی مقدار
سیستم عامل OS Independent
نام فایل TruSD-0.0.6b1
نام TruSD
نسخه کتابخانه 0.0.6b1
نگهدارنده []
ایمیل نگهدارنده []
نویسنده Mathias Bockwoldt
ایمیل نویسنده mathias.bockwoldt@gmail.com
آدرس صفحه اصلی https://github.com/mathiasbockwoldt/TruSD
آدرس اینترنتی https://pypi.org/project/TruSD/
مجوز -
# TruSD **Tr**ajectories **u**nder **S**election and **D**rift is an implementation of a method that co-infers selection coefficients and genetic drift from allele trajectories using a maximum-likelihood framework. If you find the software useful in your research please cite this package. ## Installation TruSD needs Python 3.6 or newer. Python 2 is *not* supported! TruSD was only tested on Linux (Ubuntu), but *should* work on Mac and Windows as well. We suggest to use a [virtual environment](https://docs.python.org/3/tutorial/venv.html) for use of TruSD. To install TruSD, run: ```sh pip3 install trusd # add --user to install only for the user ``` This will install TruSD as importable module and three command line tools, `trusd`, `trusd-plot`, and `trusd-sim`. ## Update If you later want to update TruSD, use the pip command: ```sh pip3 install --upgrade trusd ``` ## Running TruSD from within a Python script Import the `trusd` module from your Python 3 script: ```python # inside python3 script or interactive prompt import trusd help(trusd.trusd) # gives package content ``` For an example, download two files (for example with `wget`): ```sh wget https://github.com/mathiasbockwoldt/TruSD/blob/master/examples/min_working_example.py wget https://github.com/mathiasbockwoldt/TruSD/blob/master/examples/traj_example.txt ``` You can start an example run with ```sh python3 min_working_example.py ``` The `min_working_example.py` is documented to explain the basic steps. It uses `traj_example.txt` as input and produces `outfile.txt` (the results), `outfile.json` (the metadata) and `outfile.pdf` (the plot). ## Running TruSD as command line program The command line programs are self-explanatory using the `--help` flag. ```sh trusd --help trusd-plot --help trusd-sim --help ``` The parameters are the same as in the Python modules.


نیازمندی

مقدار نام
>=1.15.1 numpy
>=0.16.0 scipy
>=3.1.1 matplotlib


زبان مورد نیاز

مقدار نام
>=3.6 Python


نحوه نصب


نصب پکیج whl TruSD-0.0.6b1:

    pip install TruSD-0.0.6b1.whl


نصب پکیج tar.gz TruSD-0.0.6b1:

    pip install TruSD-0.0.6b1.tar.gz