معرفی شرکت ها

Sparse-Optimization-Toolbox-0.1.0

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
0.1.0
0.0.2
0.0.1
0.1.0
0.0.2
0.0.1

توضیحات

Package for Sparse optimization
ویژگی مقدار
سیستم عامل OS Independent
نام فایل Sparse-Optimization-Toolbox-0.1.0
نام Sparse-Optimization-Toolbox
نسخه کتابخانه 0.1.0
نگهدارنده []
ایمیل نگهدارنده []
نویسنده Lou jiashu
ایمیل نویسنده loujiashu@163.com
آدرس صفحه اصلی https://github.com/ljs1214/Gene-regulation-network-reasoning
آدرس اینترنتی https://pypi.org/project/Sparse-Optimization-Toolbox/
مجوز -
# An sparse opyimization toolbox contains test data generation and network reasoning ## Test Data Generation ### **Import** ```{python} from sparsetools import matCreater ``` ### **Data generation** ```{python} matCreater.matCreater(tfLen=10, sampleNums=200, geneNums=2000, normalLoc=0, normalScale=0.1) ``` | Parameter | Type | Explanation| |----------|:-------------:|------:| | tfLen| int | The numbers of transcribe factors| | sampleNums| int | The numbers of transcribe samples | |geneNums | int| The numbers of target genes | |normalLoc | float: recommond use 0| Mean value of Gaussian noise | |normalScale | float| Variance of Gaussian noise| ### **Return:** | Parameter | Type | Shapes| Explanation| |----------|:-------------:|------:|------:| | W_d| np.array | (tfLen, sampleNums)|Over complete dictionary| | zNetwork| np.array | (geneNums, tfLen)| Sparse matrix | |xTargetGene | np.array| (geneNums,sampleNums)| Target | ## Network reasoning ```{python} from sparsetools import Optimization Optimization.voting(expre, tf_names, gene_names) ``` | Parameter | Type | Explanation| |----------|:-------------:|------:| | expre| np.array | The expresion matrix of genes| |tf_names| np.array| Names of tf | |gene_names| np.array| Name of all genes(including TF) | ### **Return:** The moderation network result matrix of the voting algorithm, while the results of the independent algorithm are named with the algorithm name and stored locally.


نیازمندی

مقدار نام
- sklearn
- numpy


نحوه نصب


نصب پکیج whl Sparse-Optimization-Toolbox-0.1.0:

    pip install Sparse-Optimization-Toolbox-0.1.0.whl


نصب پکیج tar.gz Sparse-Optimization-Toolbox-0.1.0:

    pip install Sparse-Optimization-Toolbox-0.1.0.tar.gz