معرفی شرکت ها

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

Semi-automatic Pipeline for Markerless Pose Estimation and Behavior classification of mouse.

ویژگی	مقدار
سیستم عامل	OS Independent
نام فایل	SBAUtil-0.1.0
نام	SBAUtil
نسخه کتابخانه	0.1.0
نگهدارنده	[]
ایمیل نگهدارنده	[]
نویسنده	Yiyang
ایمیل نویسنده	yiyangzhou123@ucla.edu
آدرس صفحه اصلی	https://github.com/webbdevv/braindecoding
آدرس اینترنتی	https://pypi.org/project/SBAUtil/
مجوز	-

# SBA Untility functions for interaction classifcation. The module provides functions for pre-SIMBA and post-SIMBA processing. # Installation ```bash pip install SBAUtil ``` # Tutorial ```python import SBA ``` Initalize the configuration file: ```python SBA.initConfig('./',projectName = "newProject", experimenter = "Yiyang") ``` ### dynamic cut [SIMBA gives error](https://github.com/sgoldenlab/simba/blob/master/docs/FAQ.md#3-i-get-a-qhull-eg-qh6154-or-6013-error-when-extracting-the-features) if the h5file input from DLC contains a portion where there is only one mouse. `SBA.batch_dynamic_cropVideo` will 1. dynamically crop out this portion based on the given h5file from DLC. 2. modify the original DLC h5 file to match the extracted video. 3. The new videos and new h5files can then be used for SIMBA analysis ```python SBA.batch_dynamic_cropVideo(config_path,videos,h5files,videoType="avi") ``` `videos`: The path to directory of the videos. `h5files`: The path to the directory of the DLC h5 outputs. ### Post SIMBA processing `finalizeSimBaOutput` does the following: 1. Simplify the final output from SIMBA. 2. Modify the frame number field so that it matches the original video. ```python SBA.finalizeSimBaOutput(config, simbaFiles, classifier ,destDir = None) ``` `config`: path to the SBA configuration file. `simbaFiles`: path to the SIMBA output directory. It's by default in project_folder/csv/machine_results. `classifier`: list of strings containing the classifier names. For example, `["isInteraction"]` or `["Unilateral", "Reciprocal", "Passive"]`. Make sure the spelling matches the names defined in the SIMBA model.

نیازمندی

مقدار	نام
-	pandas
-	opencv-python

زبان مورد نیاز

مقدار	نام
>=3.6	Python

نحوه نصب

نصب پکیج whl SBAUtil-0.1.0:

pip install SBAUtil-0.1.0.whl

نصب پکیج tar.gz SBAUtil-0.1.0:

pip install SBAUtil-0.1.0.tar.gz