معرفی شرکت ها

PyPhyloGenomics-0.3.9

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
0.3.9
0.3.8
0.3.7
0.3.6

توضیحات

Tools to work in phylogenomics, from NSG group http://nymphalidae.utu.fi
ویژگی مقدار
سیستم عامل OS Independent
نام فایل PyPhyloGenomics-0.3.9
نام PyPhyloGenomics
نسخه کتابخانه 0.3.9
نگهدارنده []
ایمیل نگهدارنده []
نویسنده Carlos Pena, Victor Solis, Pavel Matos, Chris Wheat
ایمیل نویسنده mycalesis@gmail.com
آدرس صفحه اصلی http://carlosp420.github.com/PyPhyloGenomics/
آدرس اینترنتی https://pypi.org/project/PyPhyloGenomics/
مجوز GPL v3
PyPhyloGenomics =============== A package to work on Phylogenomics. [[In development.]] Developers ---------- - Carlos Peña (email: carlos.pena@utu.fi) - Victor Solis - Pavel Matos - Chris Wheat Installing PyPhyloGenomics -------------------------- PyPhyloGenomics has been developed in Python v2.7. The installer of PyPhyloGenomics will try to download and install all its dependencies as well. To install PyPhyloGenomics use setup.py: python setup.py build python setup.py install If it fails you can install the dependencies manually: Install dependencies: --------------------- requests: The package requests from here. Or try: sudo apt-get install python-requests Parallel Python (pp): If you are using Ubuntu Linux or related: sudo apt-get install python-pp Otherwise, download the source code and install pp: unzip pp-1.6.4.zip cd pp-1.6.4 python setup.py install BioPython: Download and install from here. Or: sudo apt-get install python-biopython BeatutifulSoup Download and install from here. Or: sudo apt-get install python-bs4 MUSCLE It is necessary that you install MUSCLE so that PyPhyloGenomics can use it to align sequences. Download and install from here. If you are using Windows you can download the executable file muscle3.8.31_i86win32.exe and save it in your Python folder (C:27) as muscle.exe. BLAST Download and install the BLAST+ executables from the NCBI website. Or try: sudo apt-get install ncbi-blast+ fastx-toolkit Download and install from here. Or: sudo apt-get install fastx-toolkit Reading PyPhyloGenomics' documentation: --------------------------------------- Read the online documentation here: http://carlosp420.github.io/PyPhyloGenomics/ Or, after installling do the following: cd doc make html Then open the file _build/html/index.html in your web-browser. Reproduce our analysis: ----------------------- You can reproduce all the steps detailed in our [Getting started with PyPhylogenomics] guide. Just use the command line in the same folder as the Makefile and type make ???


نحوه نصب


نصب پکیج whl PyPhyloGenomics-0.3.9:

    pip install PyPhyloGenomics-0.3.9.whl


نصب پکیج tar.gz PyPhyloGenomics-0.3.9:

    pip install PyPhyloGenomics-0.3.9.tar.gz