معرفی شرکت ها


PLATER-GRAPH-1.9.8rc1


Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

Graph DB interface for Translator API
ویژگی مقدار
سیستم عامل OS Independent
نام فایل PLATER-GRAPH-1.9.8rc1
نام PLATER-GRAPH
نسخه کتابخانه 1.9.8rc1
نگهدارنده ['Renci']
ایمیل نگهدارنده ['yaphetkg@renci.org']
نویسنده -
ایمیل نویسنده -
آدرس صفحه اصلی https://github.com/yaphetkg/plater.git
آدرس اینترنتی https://pypi.org/project/PLATER-GRAPH/
مجوز -
## PLATER PLATER is a service to stand up REST endpoint over a neo4j or redis graph database. There are some restrictions on the data structure of the Neo4j backend to be fully utilized through PLATER. > **Data structure restrictions:** > * All nodes should have an `id` to be searchable (Used in querying single Nodes) > * All edges should have an `id` to be searchable (Used in generating ReasonerAPI) > * Data is recommended to comply to the [Translator Reasoner API](https://github.com/NCATSTranslator/ReasonerAPI). ### Installation To run the web server directly: #### Create a virtual Environment and activate. cd <PLATER-ROOT> python<version> -m venv venv source venv/bin/activate #### Install dependencies pip install -r PLATER/requirements.txt #### Configure PLATER settings Populate `.env-template` file with settings and save as `.env` in repo root dir. ```bash WEB_HOST=0.0.0.0 WEB_PORT=8080 DB_HOST=<neo4j_or_redis_address> DB_USERNAME=<user name required for neo4j, empty for redis> DB_PASSWORD='' DB_PORT=<redis port or neo4j http port> DB_NAME=<db name for redis, uses default db for neo4j> DB_TYPE=<use values 'redis' or 'neo4j'> PLATER_TITLE='Plater' PLATER_VERSION='1.0.0' ``` #### Run Script ./main.sh ### DOCKER Or build an image and run it. ```bash cd PLATER docker build --tag <image_tag> . cd ../ ``` ```bash docker run --env-file .env\ --name plater\ -p 8080:8080\ --network <network_where_neo4j_is_running>\ plater-tst ``` ### Clustering with [Automat Server](https://github.com/RENCI-AUTOMAT/Automat-server/) \[Optional\] You can also serve several instances of plater through a common gateway(Automat). On specific instructions please refer to [AUTOMAT's readme](https://github.com/RENCI-AUTOMAT/Automat-server/blob/master/README.md) ### Miscellaneous ###### `/about` Endpoint The `/about` endpoint can be used to present meta-data about the current PLATER instance. This meta-data is served from `<repo-root>/PLATER/about.json` file. One can edit the contents of this file to suite needs. In containerized environment we recommend mounting this file as a volume. Eg: ```bash docker run -p 0.0.0.0:8999:8080 \ --env DB_HOST=<your_db_host> \ --env DB_PORT=<your_db_port> \ --env DB_USERNAME=<db_user_name required for neo4j, ignored for redis> \ --env DB_PASSWORD=<db_password> \ --env DB_NAME=<required for redis> \ --env DB_TYPE=<redis or neo4j> \ --env WEB_HOST=0.0.0.0 \ -v <your-custom-about>:/<path-to-plater-repo-home>/plater/about.json \ --network=<docker_network_neo4j_is_running_at> \ <image_tag> ```


نیازمندی

مقدار نام
- coverage
==20.3.1 pyaml
==5.4.1 pytest
==0.14.0 pytest-asyncio
==0.13.6 starlette
==0.11.7 uvicorn
- httpx
- redis


زبان مورد نیاز

مقدار نام
>=3.7 Python


نحوه نصب


نصب پکیج whl PLATER-GRAPH-1.9.8rc1:

    pip install PLATER-GRAPH-1.9.8rc1.whl


نصب پکیج tar.gz PLATER-GRAPH-1.9.8rc1:

    pip install PLATER-GRAPH-1.9.8rc1.tar.gz