معرفی شرکت ها

PEPPAN-1.0.6

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
1.0.6
1.0.5
1.0.4
1.0.3

توضیحات

Phylogeny Enhanded Prediction of PAN-genome https://doi.org/10.1101/2020.01.03.894154
ویژگی مقدار
سیستم عامل OS Independent
نام فایل PEPPAN-1.0.6
نام PEPPAN
نسخه کتابخانه 1.0.6
نگهدارنده []
ایمیل نگهدارنده []
نویسنده Zhemin Zhou
ایمیل نویسنده zhemin.zhou@warwick.ac.uk
آدرس صفحه اصلی https://github.com/zheminzhou/PEPPAN
آدرس اینترنتی https://pypi.org/project/PEPPAN/
مجوز -
About PEPPAN PEPPAN (Phylogeny Enhanced Pipeline for PAN-genome) is a pipeline that can construct a pan-genome from thousands of genetically diversified bacterial genomes. PEPPAN implements a combination of tree- and synteny-based approaches to identify and exclude paralogous genes, as well as similarity-based gene predictions that support consistent annotations of genes and pseudogenes in individual genomes. Citation If you use PEPPAN please cite the pre-print in BioRxiv: Z Zhou, M Achtman (2020) "Accurate reconstruction of the pan- and core- genomes of bacteria with PEPPA" bioRxiv, doi: `https://doi.org/10.1101/2020.01.03.894154 <https://doi.org/10.1101/2020.01.03.894154>`_ * `installation <docs/source/usage/installation.rst>`_ * `quickstart <docs/source/usage/quickstart.rst>`_ * `parameters <docs/source/usage/parameters.rst>`_ * `inputs <docs/source/usage/inputs.rst>`_ * `outputs <docs/source/usage/outputs.rst>`_


نحوه نصب


نصب پکیج whl PEPPAN-1.0.6:

    pip install PEPPAN-1.0.6.whl


نصب پکیج tar.gz PEPPAN-1.0.6:

    pip install PEPPAN-1.0.6.tar.gz