معرفی شرکت ها

NGLessPy-0.2.2

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
0.2.2
0.2
0.1

توضیحات

NGLessPy: Python interface to NGLess
ویژگی مقدار
سیستم عامل OS Independent
نام فایل NGLessPy-0.2.2
نام NGLessPy
نسخه کتابخانه 0.2.2
نگهدارنده []
ایمیل نگهدارنده []
نویسنده Luis Pedro Coelho
ایمیل نویسنده luis@luispedro.org
آدرس صفحه اصلی http://ngless.embl.de/
آدرس اینترنتی https://pypi.org/project/NGLessPy/
مجوز MIT
# NGLessPy: NGLess as a Python Embedded Language This is a variation of [NGLess](http://ngless.embl.de) as an embedded language in Python, thus enabling processing of next generation data through a Python API. See the example below. [![Build Status](https://travis-ci.org/luispedro/nglesspy.svg?branch=master)](https://travis-ci.org/luispedro/nglesspy) [![MIT licensed](https://img.shields.io/badge/license-MIT-blue.svg)](https://raw.githubusercontent.com/hyperium/hyper/master/LICENSE) [![Join the chat at https://gitter.im/luispedro/ngless](https://badges.gitter.im/Join%20Chat.svg)](https://gitter.im/luispedro/ngless?utm_source=badge&utm_medium=badge&utm_campaign=pr-badge&utm_content=badge) This is **very experimental** and can change at any time. Please [get in touch](mailto:coelho@embl.de) if you want to use it in your work. For questions, you can also use the [ngless mailing list](https://groups.google.com/forum/#!forum/ngless). ## Dependencies - [requests](http://docs.python-requests.org/) - [NGLess](http://ngless.embl.de) NGLesspy can auto-install ngless if it needs to. NGLesspy is compatible with Python 2.7 and 3.4+. ## Example Inside the [bin/](https://github.com/luispedro/nglesspy/tree/master/bin) directory, you will find several simple scripts exposing NGLess functionality as command line tools. These are also simple examples of how NGLessPy can be used. See the [tutorial](http://ngless.embl.de/nglesspy.html) for a more thorough explanation of what is going on in the example below. ```python from ngless import NGLess sc = NGLess.NGLess('0.8') sc.import_('mocat', '0.0') e = sc.env e.sample = sc.load_mocat_sample_('testing') @sc.preprocess_(e.sample, using='r') def proc(bk): bk.r = sc.substrim_(bk.r, min_quality=25) e.mapped = sc.map_(e.sample, reference='hg19') e.mapped = sc.select_(e.mapped, keep_if=['{mapped}']) sc.write_(e.mapped, ofile='ofile.sam') sc.run() ``` This is equivalent to the NGLess script ngless '0.8' import 'mocat' version '0.0' sample = load_mocat_sample('testing') preprocess_(sample) using='r': r = substrim(r, min_quality=25) mapped = map(sample, reference='hg19') mapped = select(mapped, keep_if=[{mapped}]) write(mapped, ofile='ofile.sam')


نحوه نصب


نصب پکیج whl NGLessPy-0.2.2:

    pip install NGLessPy-0.2.2.whl


نصب پکیج tar.gz NGLessPy-0.2.2:

    pip install NGLessPy-0.2.2.tar.gz