معرفی شرکت ها
MAGINE-0.1.5
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشتر
تبلیغات ما
مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.
مشاهده بیشترتوضیحات
Package to analyze biological data.
| ویژگی | مقدار |
|---|---|
| سیستم عامل | OS Independent |
| نام فایل | MAGINE-0.1.5 |
| نام | MAGINE |
| نسخه کتابخانه | 0.1.5 |
| نگهدارنده | [] |
| ایمیل نگهدارنده | [] |
| نویسنده | James Pino |
| ایمیل نویسنده | james.ch.pino@gmail.com |
| آدرس صفحه اصلی | https://github.com/LoLab-VU/Magine |
| آدرس اینترنتی | https://pypi.org/project/MAGINE/ |
| مجوز | - |
=================================================================
MAGINE : Mechanism of Action Generator involving Network Analysis
=================================================================
.. image:: https://api.codacy.com/project/badge/Grade/cba1091c58a246bfb07f7ed7f86afe24
:alt: Codacy Badge
:target: https://app.codacy.com/app/james.c.pino/MAGINE?utm_source=github.com&utm_medium=referral&utm_content=LoLab-VU/MAGINE&utm_campaign=badger
.. image:: https://travis-ci.org/LoLab-VU/MAGINE.svg?branch=master
:target: https://travis-ci.org/LoLab-VU/MAGINE
.. image:: https://codecov.io/gh/LoLab-VU/MAGINE/branch/master/graph/badge.svg
:target: https://codecov.io/gh/LoLab-VU/MAGINE
.. image:: https://readthedocs.org/projects/magine/badge/?version=latest
:target: https://magine.readthedocs.io/en/latest/?badge=latest
:alt: Documentation Status
.. image:: https://mybinder.org/badge.svg
:target: https://mybinder.org/v2/gh/LoLab-VU/MAGINE/master
.. image:: https://badges.gitter.im/LoLab-VU/MAGINE.svg
:target: https://gitter.im/LoLab-VU/MAGINE?utm_source=badge&utm_medium=badge&utm_campaign=pr-badge&utm_content=badge
:alt: Join the chat at https://gitter.im/LoLab-VU/MAGINE
MAGINE is a framework for the analysis of quantitative multi-omics data.
It was designed to handle multi-sample (time points) and multi-omics
(rnaseq, label-free proteomics, etc). Users are provided access to tools driven
around their experimental data. Provides access to enrichment analysis, biological
network construction and various visualization methods.
Documentation
=============
The manual is available online at http://magine.readthedocs.io.
.. _Anaconda: https://www.anaconda.com/distribution/#download-section
Installation
============
1. Install Anaconda
Our recommended approach is to use Anaconda_, which is a
distribution of Python containing most of the numeric and scientific
software needed to get started. If you are a Mac or Linux user, have
used Python before and are comfortable using ``pip`` to install
software, you may want to skip this step and use your existing Python
installation.
Anaconda has a simple graphical installer which can be downloaded
from https://www.anaconda.com/distribution/#download-section - select
your operating system and download the **Python 3.7 version**. The
default installer options are usually appropriate.
2. Open a terminal
We will install most packages with conda::
$ conda create -n magine_env python=3.7
$ conda activate magine_env
$ conda config --add channels conda-forge
$ conda install jinja2 statsmodels networkx graphviz
$ conda install -c marufr python-igraph
**Windows users:** Please download and install igraph and pycairo
using the wheel files provided by Christoph Gohlke, found at
https://www.lfd.uci.edu/~gohlke/ . Download and install via pip.
3. Install MAGINE
The installation is very straightforward with ``pip`` - type the following in a terminal::
$ pip install magine
4. Start Python and MAGINE
From the terminal or command prompt type ::
$ jupyter notebook
You will then be at the Python prompt. Type ``import magine`` to try
loading magine. If no error messages appear and the next Python
prompt appears, you have succeeded in installing magine!
نحوه نصب
نصب پکیج whl MAGINE-0.1.5:
pip install MAGINE-0.1.5.whl
نصب پکیج tar.gz MAGINE-0.1.5:
pip install MAGINE-0.1.5.tar.gz