معرفی شرکت ها

LigPrepper-0.4.0

Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
Card image cap
تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر
0.4.0
0.3.1
0.3.0
0.2.0
0.4.0
0.3.1
0.3.0
0.2.0

توضیحات

Simple program to quickly prepare ligand 3d SDF/MOL2/PDBQT from smiles
ویژگی مقدار
سیستم عامل OS Independent
نام فایل LigPrepper-0.4.0
نام LigPrepper
نسخه کتابخانه 0.4.0
نگهدارنده []
ایمیل نگهدارنده []
نویسنده Abhishek Kognole
ایمیل نویسنده aakognole@gmail.com
آدرس صفحه اصلی https://github.com/aakognole/ligprepper
آدرس اینترنتی https://pypi.org/project/LigPrepper/
مجوز -
# LigPrepper Simple program to quickly prepare 3D SDF/MOL2/PDBQT files from SMILES for ligands using rdkit & openbabel. Also, split sdf and convert formats sdf<->pdbqt for Autodock Vina [![PyPI version](https://badge.fury.io/py/LigPrepper.svg)](https://badge.fury.io/py/LigPrepper) [![Downloads](https://pepy.tech/badge/ligprepper)](https://pepy.tech/project/ligprepper) ## Installation: ``` pip install LigPrepper ``` ## Usage: #### For single SMILES ``` LigPrepper.smiles2sdf('c1ccncc1', labels='pyridine') LigPrepper.smiles2mol2('c1ccncc1', labels='pyridine') LigPrepper.smiles2pdbqt('c1ccncc1', labels='pyridine') ``` #### For a list of SMILES ``` LigPrepper.smiles2sdf(smiles_list, labels=labels_list, mergesdf=False) ``` #### Want to align molecule to reference molecule in SDF format ``` LigPrepper.smiles2sdf(smiles_list, labels=labels_list, ref='ref.sdf', mergesdf=False) ``` #### convert formats ``` sdf2pdbqt pdbqt2sdf ``` #### split sdf ``` splitsdf ```


نیازمندی

مقدار نام
- rdkit-pypi


زبان مورد نیاز

مقدار نام
>=3.6 Python


نحوه نصب


نصب پکیج whl LigPrepper-0.4.0:

    pip install LigPrepper-0.4.0.whl


نصب پکیج tar.gz LigPrepper-0.4.0:

    pip install LigPrepper-0.4.0.tar.gz