معرفی شرکت ها

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

تبلیغات ما

مشتریان به طور فزاینده ای آنلاین هستند. تبلیغات می تواند به آنها کمک کند تا کسب و کار شما را پیدا کنند.

مشاهده بیشتر

توضیحات

Detect all superbubbles in a graph.

ویژگی	مقدار
سیستم عامل	OS Independent
نام فایل	LSD-Bubble-2.0
نام	LSD-Bubble
نسخه کتابخانه	2.0
نگهدارنده	[]
ایمیل نگهدارنده	[]
نویسنده	Fabian Gaertner
ایمیل نویسنده	fabian@bioinf.uni-leipzig.de
آدرس صفحه اصلی	https://github.com/Fabianexe/Superbubble
آدرس اینترنتی	https://pypi.org/project/LSD-Bubble/
مجوز	BSD 3-Clause

Linear Superbubble Detector =========================== .. image:: https://raw.githubusercontent.com/Fabianexe/Superbubble/master/logo.png Introduction ------------ This project gives the reference implementation of the Linear Superbubble Dector (LSD). .. _`NetworkX`: https://networkx.github.io .. _`NetworkX can load`: https://networkx.github.io/documentation/stable/reference/readwrite/index.html Features -------- - Detect superbubbles in linear time - Uses `NetworkX`_ as graph library - Can load plenty file formats (everything that `NetworkX can load`_ ) - Have different ways to report the superbubbles - Simple and clean code - Simple to understand and reimplement Documentation ============= The documentation can be found at: https://fabianexe.github.io/Superbubble Installation ------------ The simples way to install is using pip:: pip install LSD-Bubble .. _`setuptools`: https://pypi.python.org/pypi/setuptools You can also download the source from https://github.com/Fabianexe/Superbubble and run the make script to install the package. These needs that `setuptools`_ are installed. Usage ----- The programms needs only a path to a graph file to work and the algorithm that it should use: lsd d *path* If you want other detection algorithm try: lsd p *path* or lsd o *path* If as input format not edgelist is used give the format with the -f parameter lsd d *path* -f gml If you want a different reporting format use -r lsd d *path* -r count If you want not to detect superbubbles but week superbubbles use --week: lsd d *path* --week

نیازمندی

مقدار	نام
>=2.1	networkx

نحوه نصب

نصب پکیج whl LSD-Bubble-2.0:

pip install LSD-Bubble-2.0.whl

نصب پکیج tar.gz LSD-Bubble-2.0:

pip install LSD-Bubble-2.0.tar.gz